More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01819 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  100 
 
 		 716 aa  1446    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  41.8 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 733 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 704 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 704 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 736 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 694 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 757 aa  89.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 769 aa  88.6  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 705 aa  88.6  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  24.68 
 
 		 683 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  24.45 
 
 		 748 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  25.98 
 
 		 693 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  24.24 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 779 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 686 aa  77.8  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 667 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 706 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  23.79 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 734 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 742 aa  74.3  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.94 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 757 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.8 
 
 		 726 aa  73.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  24.72 
 
 		 683 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 705 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 692 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 688 aa  71.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 678 aa  70.5  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 697 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 676 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.74 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.26 
 
 		 701 aa  68.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 723 aa  68.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 705 aa  68.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.3 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.75 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.34 
 
 		 867 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.75 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.75 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  29.75 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.75 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.75 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25 
 
 		 743 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 698 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 780 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  30.07 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  33.33 
 
 		 722 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  29.66 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  29.66 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  29.66 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  29.66 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  29.66 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  24.46 
 
 		 765 aa  64.7  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.31 
 
 		 653 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  24.57 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 791 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  27.71 
 
 		 797 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.15 
 
 		 653 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3150  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 807 aa  61.6  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.86 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1110  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.22 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  32.84 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  32.84 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  32.84 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  32.84 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 679 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  30.23 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  32.73 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  27.13 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  34.11 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  34.11 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.39 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34.71 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  34.11 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  34.11 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  34.11 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  34.15 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>