71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0345 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 678 aa  1382    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  36.28 
 
 		 765 aa  392  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  37.07 
 
 		 722 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  38.72 
 
 		 699 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  36.15 
 
 		 692 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  39.18 
 
 		 712 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 689 aa  356  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 717 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  36.74 
 
 		 723 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  36.52 
 
 		 718 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  34.33 
 
 		 765 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 740 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 672 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  33.63 
 
 		 705 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  33.93 
 
 		 686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 734 aa  263  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 750 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 760 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 757 aa  242  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 736 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  28.82 
 
 		 748 aa  230  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 704 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 704 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 733 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  28.75 
 
 		 692 aa  99  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  27.18 
 
 		 716 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  22.57 
 
 		 692 aa  54.3  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 687 aa  54.3  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 642 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 709 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 680 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 689 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 641 aa  51.6  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  30.69 
 
 		 640 aa  50.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2066  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 709 aa  50.8  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.94 
 
 		 616 aa  50.8  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.01 
 
 		 706 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 736 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 628 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.64 
 
 		 706 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.64 
 
 		 706 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 655 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 797 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.64 
 
 		 706 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.64 
 
 		 721 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  21 
 
 		 673 aa  47.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 712 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 730 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 788 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.44 
 
 		 615 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 780 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  32.2 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.19 
 
 		 1023 aa  45.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.51 
 
 		 706 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 734 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2846  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.29 
 
 		 728 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 704 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 714 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.5 
 
 		 638 aa  44.3  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 732 aa  44.3  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  26.32 
 
 		 713 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 707 aa  43.9  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>