124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0692 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  86.96 
 
 		 692 aa  1210    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  86.52 
 
 		 692 aa  1207    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 678 aa  1382    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  51.25 
 
 		 686 aa  682    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  44.38 
 
 		 722 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  44.95 
 
 		 723 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  44.92 
 
 		 699 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  43.54 
 
 		 689 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  44.41 
 
 		 712 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  44.31 
 
 		 718 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  43.17 
 
 		 740 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  40.72 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 676 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 		 705 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  41.3 
 
 		 672 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  39.52 
 
 		 717 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 689 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  38.25 
 
 		 765 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 760 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 736 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 757 aa  303  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 750 aa  296  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 734 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 748 aa  276  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 704 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 704 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 733 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.92 
 
 		 692 aa  84  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 700 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.46 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.46 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.54 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.54 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.54 
 
 		 721 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 720 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.54 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.54 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  23.64 
 
 		 716 aa  57.4  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 699 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 728 aa  56.6  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  25.83 
 
 		 699 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 681 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 794 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 743 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 820 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 714 aa  53.9  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 744 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 821 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 750 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 732 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 742 aa  53.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 715 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 733 aa  52.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 712 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 729 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 743 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 798 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.63 
 
 		 729 aa  51.6  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 733 aa  51.6  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  25.1 
 
 		 696 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  25.1 
 
 		 696 aa  51.6  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  25.1 
 
 		 698 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  25.1 
 
 		 696 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 656 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 696 aa  51.2  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.29 
 
 		 755 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  25.1 
 
 		 696 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 729 aa  50.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 		 744 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 713 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  23.86 
 
 		 701 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 779 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 723 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 715 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  24.23 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.17 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  20.74 
 
 		 700 aa  49.3  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 790 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 736 aa  48.5  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 724 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 823 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 756 aa  48.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 724 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>