More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2929 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  74.93 
 
 
747 aa  1186    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  100 
 
 
755 aa  1561    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  67.37 
 
 
739 aa  1022    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  29.02 
 
 
712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  28.85 
 
 
713 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.61 
 
 
728 aa  244  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.89 
 
 
693 aa  226  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  26.68 
 
 
712 aa  211  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  26.72 
 
 
698 aa  207  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.61 
 
 
754 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.55 
 
 
862 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.25 
 
 
750 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  25.16 
 
 
741 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.47 
 
 
867 aa  194  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.95 
 
 
730 aa  194  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.66 
 
 
859 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.87 
 
 
861 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.91 
 
 
862 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.86 
 
 
759 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.32 
 
 
862 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  25.19 
 
 
857 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.98 
 
 
714 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  27.13 
 
 
764 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.17 
 
 
757 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.03 
 
 
755 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.03 
 
 
755 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.22 
 
 
755 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.08 
 
 
767 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 
787 aa  167  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.81 
 
 
810 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.76 
 
 
759 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.76 
 
 
769 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.59 
 
 
767 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.63 
 
 
764 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.63 
 
 
767 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  24.63 
 
 
767 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  26.13 
 
 
764 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.63 
 
 
718 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.85 
 
 
769 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0337  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 
800 aa  161  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770898  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  26.5 
 
 
458 aa  160  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.21 
 
 
766 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0329  TonB-dependent receptor  25 
 
 
800 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.5 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.77 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1213  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
799 aa  147  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.69 
 
 
752 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.76 
 
 
762 aa  141  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  24.72 
 
 
728 aa  135  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2831  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
808 aa  134  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 
698 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0582  heme uptake protein  23.98 
 
 
788 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000461965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.82 
 
 
755 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  22.67 
 
 
652 aa  111  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 
649 aa  111  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.25 
 
 
666 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.09 
 
 
731 aa  107  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.2 
 
 
695 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 
717 aa  104  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
710 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.68 
 
 
666 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.9 
 
 
666 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.9 
 
 
666 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.92 
 
 
666 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
679 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.42 
 
 
681 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.4 
 
 
680 aa  99.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.27 
 
 
688 aa  97.8  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.38 
 
 
697 aa  96.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  27.86 
 
 
248 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.55 
 
 
696 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.2 
 
 
704 aa  97.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  21.56 
 
 
688 aa  95.9  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
683 aa  95.5  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  21.46 
 
 
744 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  21.47 
 
 
744 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
735 aa  94.4  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.11 
 
 
696 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  22.63 
 
 
653 aa  94  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  20.96 
 
 
746 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.75 
 
 
696 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.32 
 
 
696 aa  92.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.11 
 
 
696 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.25 
 
 
694 aa  91.3  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  20.41 
 
 
757 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  21.36 
 
 
744 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  20.55 
 
 
746 aa  88.6  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  24.89 
 
 
490 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
716 aa  88.2  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
652 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0449  transferrin-binding protein A  29.52 
 
 
992 aa  88.2  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0459359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 
613 aa  87.8  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  23.45 
 
 
721 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  22.3 
 
 
650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  22.59 
 
 
650 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  21.87 
 
 
702 aa  85.9  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 
662 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 
729 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 
812 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 
680 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>