126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5682 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3944  TonB-dependent receptor  50.46 
 
 		 689 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.677577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5682  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 672 aa  1356    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3038  TonB-dependent receptor  58.57 
 
 		 740 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2413  TonB-dependent receptor, plug  58.41 
 
 		 718 aa  758    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0232072  normal  0.0153197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6192  putative outer membrane receptor  52.9 
 
 		 765 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.893416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4063  TonB-dependent receptor plug  82.08 
 
 		 712 aa  1108    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1004  TonB-dependent receptor plug  78.27 
 
 		 689 aa  1061    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5240  TonB-dependent receptor  58.85 
 
 		 723 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1233  TonB-dependent receptor  49.3 
 
 		 705 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.345328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2798  putative outer membrane receptor signal peptide protein  48.46 
 
 		 722 aa  611  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.975651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2922  putative outer membrane receptor signal peptide protein  49.46 
 
 		 699 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2872  TonB-dependent receptor  45.4 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1684  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0676339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2180  TonB-dependent receptor, putative  42.19 
 
 		 765 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3541  TonB-dependent receptor  42.57 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737  TonB-dependent receptor, putative  41.61 
 
 		 692 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0692  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01572  TonB-dependent receptor, putative  39.45 
 
 		 686 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0345  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1720  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 760 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6273  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 736 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000590633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3901  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 734 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.707047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  32.76 
 
 		 748 aa  304  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 757 aa  293  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 750 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 704 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 704 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  26.32 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.78 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.47 
 
 		 743 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3269  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 723 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 700 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 708 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 628 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  28.57 
 
 		 700 aa  52  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.48 
 
 		 614 aa  52  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  28.57 
 
 		 700 aa  52  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.48 
 
 		 614 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 700 aa  52  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.48 
 
 		 614 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 700 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.48 
 
 		 614 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 700 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.48 
 
 		 614 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 700 aa  51.6  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.56 
 
 		 614 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  45.45 
 
 		 671 aa  50.8  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 682 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 732 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  23.83 
 
 		 738 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  25.17 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.74 
 
 		 630 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 744 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 844 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  20.5 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  20.5 
 
 		 778 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 743 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  21.83 
 
 		 680 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.63 
 
 		 623 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 743 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 690 aa  48.5  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 667 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.09 
 
 		 615 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  22.93 
 
 		 705 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 615 aa  48.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 744 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.82 
 
 		 630 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.41 
 
 		 616 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 631 aa  48.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.82 
 
 		 630 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 742 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 665 aa  47.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  21.71 
 
 		 776 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 702 aa  47.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 733 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4448  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 678 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634501  normal  0.211596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 714 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.61 
 
 		 631 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 726 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 730 aa  46.6  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 680 aa  46.6  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  27.07 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>