More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1328 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  46.36 
 
 		 813 aa  688    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  46.11 
 
 		 846 aa  687    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  44.54 
 
 		 807 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 821 aa  539  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 731 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 739 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 736 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 777 aa  105  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 675 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 696 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 782 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.64 
 
 		 774 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.7 
 
 		 782 aa  99  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 		 774 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.21 
 
 		 687 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 688 aa  96.3  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  21.61 
 
 		 705 aa  94.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  22.32 
 
 		 693 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 782 aa  93.2  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 809 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23 
 
 		 774 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23 
 
 		 774 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23 
 
 		 774 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23 
 
 		 774 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 774 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 809 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 721 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 721 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.31 
 
 		 809 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.07 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.44 
 
 		 708 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  21.53 
 
 		 711 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  21.61 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 809 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.22 
 
 		 704 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  21.63 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.17 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  22.3 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  21.07 
 
 		 703 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.28 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.3 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.03 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.63 
 
 		 784 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  22.64 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 770 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  29.06 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  21.84 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  27.46 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 824 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.97 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  26.7 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  22.05 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  20.72 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.91 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 678 aa  62  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 780 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 932 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 675 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 797 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 621 aa  59.3  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  25 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1310  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 704 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.475424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 772 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1472  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 704 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.78 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 780 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 774 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.98 
 
 		 752 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 748 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 748 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  28.26 
 
 		 960 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  21.66 
 
 		 740 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  21.71 
 
 		 729 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1571  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 804 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579738  normal  0.0739696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 709 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  22.25 
 
 		 749 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 662 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5111  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 733 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 791 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 747 aa  55.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 961 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 785 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 678 aa  55.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>