More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2591 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2591  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
797 aa  1632    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.53 
 
 
833 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  40.08 
 
 
715 aa  446  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 
794 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  34.91 
 
 
753 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 
820 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 
828 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.23 
 
 
808 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.55 
 
 
797 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 
828 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  35.13 
 
 
750 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.52 
 
 
689 aa  364  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  33.55 
 
 
806 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
828 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 
785 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 
785 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  33.29 
 
 
729 aa  353  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 
797 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 
784 aa  351  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.22 
 
 
810 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  34 
 
 
729 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  35.07 
 
 
747 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  34.45 
 
 
714 aa  347  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 
752 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  33.61 
 
 
717 aa  346  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 
736 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 
736 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  33.51 
 
 
789 aa  346  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  32.8 
 
 
741 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  32.95 
 
 
753 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  32.95 
 
 
753 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
737 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 
738 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  34.53 
 
 
829 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 
740 aa  343  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 
748 aa  343  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 
745 aa  342  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 
810 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  34.29 
 
 
745 aa  340  9e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  34.33 
 
 
747 aa  337  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  34.33 
 
 
747 aa  336  9e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  34.2 
 
 
747 aa  335  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 
745 aa  333  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 
828 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  32.65 
 
 
729 aa  331  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  32.65 
 
 
729 aa  331  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 
701 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 
705 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  33.74 
 
 
747 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 
735 aa  330  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  33.29 
 
 
747 aa  330  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 
747 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  34.2 
 
 
747 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 
810 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 
736 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  35.32 
 
 
771 aa  329  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  34.51 
 
 
785 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 
810 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.96 
 
 
801 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  32.55 
 
 
703 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  33.6 
 
 
747 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  32.55 
 
 
703 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  32.55 
 
 
729 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  35.46 
 
 
771 aa  325  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  33.56 
 
 
752 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 
754 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 
754 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 
754 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
745 aa  319  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 
743 aa  318  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 
750 aa  317  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 
734 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 
812 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 
797 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  32.42 
 
 
808 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 
753 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 
729 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  31.77 
 
 
696 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
696 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  31.77 
 
 
696 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 
757 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  31.62 
 
 
696 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 
757 aa  308  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  31.27 
 
 
696 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
815 aa  307  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 
729 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  31.62 
 
 
698 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 
737 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 
705 aa  304  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 
776 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  31.25 
 
 
711 aa  300  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  30.01 
 
 
750 aa  300  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 
779 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 
806 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 
802 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 
829 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  33.04 
 
 
754 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 
769 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6351  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 
725 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532557  normal  0.487523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>