201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3796 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1182 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  30.65 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1192 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  38.32 
 
 		 772 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 795 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  41.28 
 
 		 1059 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 833 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 988 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 1063 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 807 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  33.56 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 845 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 767 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  34.51 
 
 		 1032 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 866 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 793 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 828 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1076 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  31.9 
 
 		 808 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 943 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 786 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 735 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 996 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 791 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 775 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 		 1038 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1041 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 929 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  31.91 
 
 		 930 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 818 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 836 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 952 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 924 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  30.58 
 
 		 848 aa  53.9  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1077 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 1056 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 999 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1047 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1146 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 810 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1076 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1100 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 809 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  30.17 
 
 		 828 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 791 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 897 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1102 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 798 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 1089 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 787 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 1031 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 783 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 962 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 994 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 888 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  31.58 
 
 		 833 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1047 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 958 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1106 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  30.08 
 
 		 995 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 828 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1059 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 971 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1059 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 1001 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1064 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 763 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1070 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  29.09 
 
 		 780 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 935 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  31.61 
 
 		 946 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 747 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  33.59 
 
 		 926 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 759 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 792 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 1050 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 938 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1040 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 777 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 907 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 991 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 788 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 924 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 1008 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  30.12 
 
 		 854 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 810 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>