293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12863 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1677    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  47.11 
 
 		 829 aa  767    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  35.17 
 
 		 816 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  32.54 
 
 		 849 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  26.89 
 
 		 905 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  25.81 
 
 		 854 aa  260  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  24.36 
 
 		 839 aa  164  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  23.68 
 
 		 857 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  27.81 
 
 		 930 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  25.28 
 
 		 853 aa  148  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  25.2 
 
 		 853 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  24.6 
 
 		 828 aa  144  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  21.87 
 
 		 843 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  24.45 
 
 		 856 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  22.81 
 
 		 848 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  22.57 
 
 		 841 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  24.35 
 
 		 855 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  22.32 
 
 		 838 aa  90.1  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  37.62 
 
 		 882 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 927 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  24.12 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1064 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 1175 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  27.07 
 
 		 831 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 929 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 994 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.67 
 
 		 1181 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1040 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1114 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1051 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  43.21 
 
 		 1188 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  22.01 
 
 		 925 aa  60.8  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 1076 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1058 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1008 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1182 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 1100 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1168 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 		 1128 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 1089 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 1038 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  42.65 
 
 		 1192 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1076 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 1051 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1066 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1034 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  32.74 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  40.3 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 874 aa  58.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  39.6 
 
 		 971 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1077 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1020 aa  57.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 1063 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1043 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1148 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 1137 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1020 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1127 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 1161 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 786 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 952 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 933 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1124 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  32.71 
 
 		 788 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 814 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  36.45 
 
 		 1025 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  36.45 
 
 		 709 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 		 1043 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10568  hypothetical protein  22.83 
 
 		 425 aa  56.2  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1105 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1021 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 922 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 716 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1019 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 924 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1127 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1006 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 759 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  36.44 
 
 		 806 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  31.68 
 
 		 808 aa  54.7  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  32.71 
 
 		 803 aa  54.7  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1070 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1102 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 924 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1033 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1046 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 957 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  37.93 
 
 		 1005 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  32.69 
 
 		 1030 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 1026 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1147 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  40.23 
 
 		 1189 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  38.2 
 
 		 1084 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1163 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 809 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1104 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>