114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0263 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  41.55 
 
 		 854 aa  657    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  49.34 
 
 		 930 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  100 
 
 		 905 aa  1857    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  26.89 
 
 		 828 aa  282  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  28.38 
 
 		 849 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  25.45 
 
 		 829 aa  254  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  29.81 
 
 		 816 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  22.9 
 
 		 925 aa  129  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  25.44 
 
 		 856 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  24.1 
 
 		 839 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  25.38 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  22.3 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1008 aa  62.4  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  24.76 
 
 		 843 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  22.54 
 
 		 853 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 933 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  28.86 
 
 		 831 aa  55.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  38.53 
 
 		 1080 aa  55.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1001 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1189 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1077 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 924 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  34.21 
 
 		 1095 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 924 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.83 
 
 		 1028 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 772 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1102 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1079 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 787 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  25.75 
 
 		 857 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  29.46 
 
 		 800 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  34.13 
 
 		 824 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  38.39 
 
 		 1040 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 753 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 735 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1056 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  22.77 
 
 		 848 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  33.9 
 
 		 915 aa  50.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 760 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1071 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1074 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1040 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1103 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1038 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1100 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1038 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 817 aa  48.9  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 800 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1095 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1181 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1176 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  36.13 
 
 		 780 aa  47.8  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 927 aa  47.8  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1188 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 814 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  22.02 
 
 		 841 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1198 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1012 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1041 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1148 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 943 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 1020 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1067 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  32.8 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 792 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 827 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  29.17 
 
 		 1203 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1105 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1070 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 		 789 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  36.14 
 
 		 1023 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1072 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.85 
 
 		 815 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 1018 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1034 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1123 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1188 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1081 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1050 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1129 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 775 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 847 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 988 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 1004 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1107 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1075 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 822 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1120 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 810 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  32.73 
 
 		 1047 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1165 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1142 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1071 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 933 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1064 aa  45.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 818 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>