More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10788 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1131  hypothetical protein  30.13 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.543698 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  60.47 
 
 		 1025 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1130  hypothetical protein  32.91 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.396679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  55.56 
 
 		 874 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  58.11 
 
 		 1083 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  47.92 
 
 		 1034 aa  86.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  47.92 
 
 		 1020 aa  86.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  44.33 
 
 		 1064 aa  83.2  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  44.44 
 
 		 1008 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  42.71 
 
 		 1008 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1128  hypothetical protein  39.25 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.499408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  47.13 
 
 		 1040 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  48.39 
 
 		 1047 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  45.16 
 
 		 1035 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  44.09 
 
 		 1134 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 		 887 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  48.31 
 
 		 1107 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  46.59 
 
 		 1028 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  45.65 
 
 		 1051 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  40.62 
 
 		 1095 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  49.47 
 
 		 1139 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 		 1148 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  42.55 
 
 		 1155 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1237 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  43.37 
 
 		 1010 aa  72.4  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  43.53 
 
 		 1110 aa  72.4  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  47.13 
 
 		 1096 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  47.87 
 
 		 1138 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  47.25 
 
 		 1080 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  48.39 
 
 		 1018 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  37.98 
 
 		 1099 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  40.57 
 
 		 1070 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  45.56 
 
 		 1034 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  43.82 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  45.45 
 
 		 1079 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  45.65 
 
 		 1148 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05685  putative outer membrane protein  80 
 
 		 66 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 1189 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  38.52 
 
 		 1146 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  45.74 
 
 		 1068 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  45.36 
 
 		 1188 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  44.68 
 
 		 1058 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 1043 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  40.4 
 
 		 1038 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  39.09 
 
 		 1137 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 1013 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  45.05 
 
 		 989 aa  69.7  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  42.55 
 
 		 1095 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  42.7 
 
 		 1046 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1114 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  43.01 
 
 		 1045 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  45.35 
 
 		 1065 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1018 aa  68.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 1039 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  44.44 
 
 		 979 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  44.68 
 
 		 1010 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  41.76 
 
 		 1011 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 1084 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  47.52 
 
 		 1047 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  44.57 
 
 		 971 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 1090 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  39.77 
 
 		 1003 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  45.88 
 
 		 1012 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  44.09 
 
 		 1127 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  47.13 
 
 		 1023 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  36.13 
 
 		 1168 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1155 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 1031 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  42.35 
 
 		 1120 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1153 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  43.33 
 
 		 1008 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1096 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 1016 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  39.36 
 
 		 1047 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  41.49 
 
 		 1037 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  42.05 
 
 		 1023 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1100 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  40.43 
 
 		 1053 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1014 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  45.56 
 
 		 1072 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  41.49 
 
 		 1076 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1049 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  43.01 
 
 		 1023 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  44.59 
 
 		 1098 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  50.79 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  39.36 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1024 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  38.83 
 
 		 1076 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  41.38 
 
 		 1168 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  45.71 
 
 		 1185 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  41.24 
 
 		 993 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  42.11 
 
 		 1084 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  41.05 
 
 		 1030 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  42.39 
 
 		 1004 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 		 994 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 1045 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  45.16 
 
 		 1071 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 1114 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 1040 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>