122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3079 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  100 
 
 		 930 aa  1918    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  48.45 
 
 		 905 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  40.45 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  26.6 
 
 		 849 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  25.21 
 
 		 816 aa  204  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  29.24 
 
 		 829 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  28.01 
 
 		 828 aa  148  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  23.02 
 
 		 925 aa  147  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  24.52 
 
 		 839 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  25.77 
 
 		 843 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  25.48 
 
 		 856 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 924 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  21.6 
 
 		 828 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 922 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  20.66 
 
 		 853 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 817 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  21.89 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  26.21 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 795 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  30 
 
 		 409 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1107 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1181 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 753 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 982 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 816 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1103 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  30.97 
 
 		 855 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1079 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1102 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1165 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 785 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 791 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.86 
 
 		 957 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1098 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1105 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  30.3 
 
 		 857 aa  51.2  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1148 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 792 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1008 aa  51.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1041 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 791 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 1031 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  21.64 
 
 		 848 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1095 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1087 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1011 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1119 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1103 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 814 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 735 aa  48.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 927 aa  48.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 794 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1176 aa  48.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 874 aa  48.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1127 aa  47.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 1237 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.08 
 
 		 1065 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.45 
 
 		 808 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 809 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1077 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 999 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1148 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 1051 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 988 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 797 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  30.36 
 
 		 1095 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 1055 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1040 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1008 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1072 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 776 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  26.76 
 
 		 381 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1219 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  31.71 
 
 		 977 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  31.4 
 
 		 767 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1110 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 887 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 814 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1056 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 769 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1192 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1109 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1114 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  34.41 
 
 		 915 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  30.53 
 
 		 848 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 1023 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1057 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1189 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 917 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 998 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 786 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  25 
 
 		 831 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 812 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4695  hypothetical protein  29.41 
 
 		 509 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.209571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>