34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4695 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4695  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  967    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.209571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4143  hypothetical protein  38 
 
 		 773 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 		 788 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  31.95 
 
 		 1058 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 907 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4169  hypothetical protein  37.33 
 
 		 773 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.10155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 747 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 794 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  28.09 
 
 		 788 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  32.72 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 776 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 760 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 798 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 782 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2241  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 		 165 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176213  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 809 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  36.59 
 
 		 960 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.07 
 
 		 577 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 791 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1729  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 852 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29.9 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 795 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0742  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1711 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4027  hypothetical protein  35.29 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  29.41 
 
 		 930 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.43 
 
 		 633 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  22.83 
 
 		 814 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2352  fibronectin, type III domain-containing protein  30.39 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0852  hypothetical protein  31.03 
 
 		 633 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  35.37 
 
 		 961 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 795 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  36.13 
 
 		 773 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 807 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1066 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>