More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4116 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  100 
 
 		 1058 aa  2028    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  51.35 
 
 		 734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  50.14 
 
 		 729 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  53.09 
 
 		 726 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  46.68 
 
 		 734 aa  532  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  47.76 
 
 		 735 aa  529  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  48.7 
 
 		 723 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  47.57 
 
 		 755 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  45.9 
 
 		 728 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  47.48 
 
 		 731 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  46.72 
 
 		 807 aa  514  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  48.44 
 
 		 724 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  45.77 
 
 		 737 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  45.68 
 
 		 735 aa  502  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  46.66 
 
 		 732 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  44.5 
 
 		 793 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  44.14 
 
 		 787 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  49.32 
 
 		 738 aa  482  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  44.92 
 
 		 734 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  44.39 
 
 		 832 aa  479  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  46.67 
 
 		 737 aa  476  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  40.97 
 
 		 779 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  39.69 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.25 
 
 		 893 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  50.41 
 
 		 726 aa  446  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  36.34 
 
 		 704 aa  439  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.81 
 
 		 920 aa  438  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  39.9 
 
 		 791 aa  426  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.32 
 
 		 732 aa  423  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  41.55 
 
 		 1002 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  37.99 
 
 		 772 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  38.39 
 
 		 909 aa  415  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  37.99 
 
 		 772 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  37.87 
 
 		 772 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.59 
 
 		 1092 aa  412  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.28 
 
 		 854 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.11 
 
 		 1382 aa  405  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.74 
 
 		 742 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.78 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  43.71 
 
 		 840 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.69 
 
 		 735 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.94 
 
 		 760 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  41.25 
 
 		 958 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.73 
 
 		 746 aa  386  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.45 
 
 		 735 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  43.46 
 
 		 843 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  38.18 
 
 		 917 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  38.59 
 
 		 787 aa  379  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  37.9 
 
 		 784 aa  379  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.13 
 
 		 743 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  37.23 
 
 		 717 aa  357  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.13 
 
 		 842 aa  353  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.59 
 
 		 752 aa  349  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  38.8 
 
 		 903 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  37.52 
 
 		 732 aa  347  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.13 
 
 		 781 aa  345  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.41 
 
 		 758 aa  337  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.96 
 
 		 718 aa  336  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.98 
 
 		 751 aa  334  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  36.07 
 
 		 876 aa  330  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.79 
 
 		 749 aa  330  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.14 
 
 		 737 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  38.96 
 
 		 903 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.7 
 
 		 723 aa  318  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  36.05 
 
 		 726 aa  314  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.6 
 
 		 715 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  38.12 
 
 		 724 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.99 
 
 		 711 aa  302  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.7 
 
 		 761 aa  295  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.07 
 
 		 743 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.32 
 
 		 796 aa  290  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.47 
 
 		 740 aa  287  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.27 
 
 		 714 aa  264  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.38 
 
 		 750 aa  264  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.69 
 
 		 979 aa  244  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.51 
 
 		 983 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.51 
 
 		 983 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.83 
 
 		 978 aa  239  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.1 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.98 
 
 		 733 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.16 
 
 		 968 aa  231  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.1 
 
 		 710 aa  229  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.37 
 
 		 751 aa  225  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.48 
 
 		 731 aa  224  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.58 
 
 		 734 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.5 
 
 		 846 aa  218  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.24 
 
 		 738 aa  214  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  34.5 
 
 		 836 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  30.32 
 
 		 743 aa  211  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.32 
 
 		 766 aa  209  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.39 
 
 		 741 aa  208  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.03 
 
 		 1308 aa  208  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  33.68 
 
 		 737 aa  206  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  27.42 
 
 		 966 aa  206  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.78 
 
 		 796 aa  204  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  32.36 
 
 		 741 aa  204  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.29 
 
 		 727 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.91 
 
 		 743 aa  202  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>