More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1745 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  65.51 
 
 		 726 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  64.6 
 
 		 738 aa  721    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  72.05 
 
 		 734 aa  906    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  100 
 
 		 726 aa  1376    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  72.97 
 
 		 729 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  52.8 
 
 		 723 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  51.46 
 
 		 728 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  53.09 
 
 		 1058 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  52.29 
 
 		 755 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  50.34 
 
 		 734 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  50.07 
 
 		 731 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  50.07 
 
 		 735 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  48.91 
 
 		 832 aa  542  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  48.7 
 
 		 737 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  51.19 
 
 		 724 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  49.26 
 
 		 735 aa  532  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  47.36 
 
 		 793 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  47.48 
 
 		 734 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  45.79 
 
 		 779 aa  505  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  46.83 
 
 		 807 aa  505  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  46.02 
 
 		 787 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  48.17 
 
 		 732 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  43.03 
 
 		 732 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  42.94 
 
 		 909 aa  475  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  42.45 
 
 		 779 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  42.21 
 
 		 920 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  36.44 
 
 		 829 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  36.44 
 
 		 829 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  43.64 
 
 		 917 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.82 
 
 		 772 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.82 
 
 		 772 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  40.82 
 
 		 772 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  36.66 
 
 		 893 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  44.3 
 
 		 1002 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  45.36 
 
 		 737 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  45.84 
 
 		 854 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.9 
 
 		 1382 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  36.62 
 
 		 704 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.99 
 
 		 746 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 		 903 aa  419  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.56 
 
 		 1092 aa  419  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  37.68 
 
 		 760 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  40.08 
 
 		 791 aa  419  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  38.01 
 
 		 742 aa  416  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  45.86 
 
 		 903 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  45.8 
 
 		 840 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.31 
 
 		 735 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.71 
 
 		 743 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  38.6 
 
 		 752 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  41.26 
 
 		 784 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  40.96 
 
 		 958 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  43.95 
 
 		 843 aa  379  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  40.28 
 
 		 787 aa  357  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.85 
 
 		 717 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.46 
 
 		 842 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.47 
 
 		 758 aa  352  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.92 
 
 		 718 aa  350  6e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  37.47 
 
 		 732 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.66 
 
 		 726 aa  344  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.97 
 
 		 737 aa  343  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.39 
 
 		 735 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.36 
 
 		 729 aa  340  8e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  36.31 
 
 		 876 aa  337  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  38.77 
 
 		 751 aa  330  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.73 
 
 		 749 aa  323  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.31 
 
 		 715 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.66 
 
 		 723 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.4 
 
 		 711 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  38.83 
 
 		 724 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.1 
 
 		 781 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.78 
 
 		 740 aa  297  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.19 
 
 		 714 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.78 
 
 		 750 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.06 
 
 		 761 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.73 
 
 		 968 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.24 
 
 		 978 aa  259  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  36.96 
 
 		 836 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.04 
 
 		 979 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.69 
 
 		 983 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.69 
 
 		 983 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.65 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.56 
 
 		 966 aa  244  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.97 
 
 		 741 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.79 
 
 		 846 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.54 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  34.76 
 
 		 734 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.5 
 
 		 743 aa  227  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.12 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.71 
 
 		 758 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.66 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.19 
 
 		 736 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  25.68 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.34 
 
 		 710 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  31 
 
 		 737 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  25.54 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.41 
 
 		 730 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  25.51 
 
 		 730 aa  213  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.84 
 
 		 757 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.61 
 
 		 743 aa  211  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  26.55 
 
 		 997 aa  211  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>