More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1120 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  100 
 
 		 854 aa  1667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  58.86 
 
 		 791 aa  857    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  55.7 
 
 		 1092 aa  690    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  46.82 
 
 		 840 aa  635  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  45.74 
 
 		 843 aa  618  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  42.96 
 
 		 958 aa  615  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  48.52 
 
 		 779 aa  492  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  47.39 
 
 		 728 aa  485  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  46.71 
 
 		 723 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  47.29 
 
 		 832 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.76 
 
 		 734 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  44.22 
 
 		 731 aa  473  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  36.76 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  36.76 
 
 		 829 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  38.76 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  38.76 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  46.1 
 
 		 755 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  38.6 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  41.55 
 
 		 787 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  41.49 
 
 		 784 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  45.61 
 
 		 735 aa  435  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  35.84 
 
 		 893 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  47.23 
 
 		 787 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  42.88 
 
 		 737 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  44.73 
 
 		 735 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  35.83 
 
 		 779 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.14 
 
 		 793 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.14 
 
 		 734 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  40.27 
 
 		 920 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  45.92 
 
 		 729 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.73 
 
 		 724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  37.62 
 
 		 917 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  41.34 
 
 		 909 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.57 
 
 		 1382 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  41.73 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.19 
 
 		 732 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.9 
 
 		 704 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  45.84 
 
 		 726 aa  364  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  39.74 
 
 		 1002 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  39.71 
 
 		 1058 aa  355  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.25 
 
 		 842 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  35.09 
 
 		 742 aa  351  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.6 
 
 		 743 aa  351  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  42.04 
 
 		 807 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  43.49 
 
 		 732 aa  350  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.18 
 
 		 737 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  45.54 
 
 		 738 aa  331  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  36.52 
 
 		 735 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.48 
 
 		 732 aa  326  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  40.26 
 
 		 903 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.67 
 
 		 751 aa  320  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  38.08 
 
 		 760 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  39.69 
 
 		 903 aa  317  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.58 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  34.84 
 
 		 876 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  43.8 
 
 		 726 aa  314  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.82 
 
 		 746 aa  313  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39.96 
 
 		 758 aa  308  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  37.75 
 
 		 752 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  37.09 
 
 		 749 aa  301  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.48 
 
 		 781 aa  300  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.75 
 
 		 717 aa  300  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.64 
 
 		 723 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.11 
 
 		 715 aa  294  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  41.96 
 
 		 737 aa  294  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.55 
 
 		 718 aa  293  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.06 
 
 		 735 aa  283  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.22 
 
 		 711 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.91 
 
 		 714 aa  276  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.2 
 
 		 796 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  36.25 
 
 		 726 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.93 
 
 		 740 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.64 
 
 		 761 aa  257  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.09 
 
 		 724 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.85 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.28 
 
 		 979 aa  227  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.98 
 
 		 983 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.98 
 
 		 983 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.46 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  37.15 
 
 		 743 aa  224  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.04 
 
 		 978 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  33.01 
 
 		 836 aa  210  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.81 
 
 		 968 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  33.21 
 
 		 743 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.08 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.99 
 
 		 966 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.31 
 
 		 737 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.21 
 
 		 730 aa  197  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.88 
 
 		 757 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.05 
 
 		 730 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.9 
 
 		 730 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.74 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.74 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.74 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  30.81 
 
 		 737 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.04 
 
 		 730 aa  194  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.57 
 
 		 743 aa  194  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  29.84 
 
 		 794 aa  194  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 		 736 aa  194  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.59 
 
 		 730 aa  193  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>