More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0482 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  47.59 
 
 		 917 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  48.31 
 
 		 920 aa  719    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  100 
 
 		 909 aa  1786    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  48.76 
 
 		 1002 aa  635  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  49.57 
 
 		 903 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  48.12 
 
 		 903 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  46.05 
 
 		 731 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  45.14 
 
 		 734 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  44.31 
 
 		 737 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  44.55 
 
 		 755 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  45.27 
 
 		 787 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  44.05 
 
 		 832 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  43.61 
 
 		 728 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  44.17 
 
 		 723 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.96 
 
 		 724 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  43.05 
 
 		 735 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  40.15 
 
 		 779 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  42.74 
 
 		 735 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  42.84 
 
 		 734 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  37.26 
 
 		 829 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.36 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  37.26 
 
 		 829 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  41.9 
 
 		 793 aa  476  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.36 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  41.96 
 
 		 732 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  40.36 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  39.27 
 
 		 742 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  36 
 
 		 893 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  39.56 
 
 		 779 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  42.86 
 
 		 729 aa  442  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  37.96 
 
 		 743 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  44.78 
 
 		 843 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  41.92 
 
 		 734 aa  429  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.31 
 
 		 746 aa  426  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  39.95 
 
 		 787 aa  426  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  42.94 
 
 		 726 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  38.49 
 
 		 791 aa  416  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  39.25 
 
 		 784 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.04 
 
 		 842 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.1 
 
 		 854 aa  416  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  43.32 
 
 		 840 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  41.36 
 
 		 807 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.02 
 
 		 704 aa  398  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.47 
 
 		 1382 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1092 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.2 
 
 		 732 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  42.16 
 
 		 738 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  38.1 
 
 		 1058 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  40.71 
 
 		 958 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.24 
 
 		 735 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  35.01 
 
 		 760 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.94 
 
 		 735 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  43.13 
 
 		 726 aa  365  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.78 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 718 aa  362  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 751 aa  360  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  38.71 
 
 		 732 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  35.3 
 
 		 876 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  39.54 
 
 		 737 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  36.27 
 
 		 715 aa  351  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.35 
 
 		 723 aa  346  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  35.51 
 
 		 752 aa  344  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.9 
 
 		 717 aa  342  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.85 
 
 		 796 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  32.97 
 
 		 737 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.41 
 
 		 758 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.25 
 
 		 711 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.15 
 
 		 740 aa  323  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.74 
 
 		 750 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.89 
 
 		 749 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.44 
 
 		 781 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.3 
 
 		 714 aa  314  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.26 
 
 		 761 aa  312  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.96 
 
 		 743 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.4 
 
 		 726 aa  284  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.36 
 
 		 724 aa  275  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.74 
 
 		 743 aa  256  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  35.14 
 
 		 836 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.79 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.78 
 
 		 730 aa  240  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.91 
 
 		 983 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.91 
 
 		 983 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.76 
 
 		 979 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.87 
 
 		 730 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.73 
 
 		 730 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.98 
 
 		 738 aa  238  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.73 
 
 		 730 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.73 
 
 		 730 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.73 
 
 		 730 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.17 
 
 		 730 aa  237  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.05 
 
 		 730 aa  234  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.72 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.06 
 
 		 741 aa  231  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.78 
 
 		 978 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.87 
 
 		 740 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  30.48 
 
 		 734 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.93 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.52 
 
 		 736 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.43 
 
 		 968 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.37 
 
 		 966 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>