More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4524 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 746 aa  1477    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  43.71 
 
 		 779 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.59 
 
 		 734 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  45.16 
 
 		 755 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  43.09 
 
 		 728 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  43.1 
 
 		 832 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  43.28 
 
 		 731 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.56 
 
 		 1382 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  43.34 
 
 		 723 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  42.33 
 
 		 735 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  41.7 
 
 		 735 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  41.52 
 
 		 737 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  43.15 
 
 		 724 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  39.66 
 
 		 787 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  38.17 
 
 		 909 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  35.38 
 
 		 920 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.34 
 
 		 829 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.34 
 
 		 829 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  36.32 
 
 		 893 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 		 793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  38.51 
 
 		 732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  37.47 
 
 		 779 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.81 
 
 		 742 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  38.06 
 
 		 734 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.31 
 
 		 734 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  39.47 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  37.03 
 
 		 917 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  36.54 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  36.54 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  36.54 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.4 
 
 		 752 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  36.63 
 
 		 1002 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  33.56 
 
 		 743 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.43 
 
 		 717 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.98 
 
 		 729 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  33.65 
 
 		 843 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  40.92 
 
 		 726 aa  360  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  37.66 
 
 		 840 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.85 
 
 		 704 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  36.76 
 
 		 1058 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.7 
 
 		 758 aa  356  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.76 
 
 		 735 aa  353  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  38.35 
 
 		 732 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  34.67 
 
 		 791 aa  339  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  36.01 
 
 		 903 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.21 
 
 		 842 aa  334  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  38.65 
 
 		 738 aa  331  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  34.15 
 
 		 784 aa  325  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  39.23 
 
 		 854 aa  324  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.33 
 
 		 735 aa  323  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.79 
 
 		 718 aa  323  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  38.91 
 
 		 1092 aa  321  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  35.2 
 
 		 807 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  35.42 
 
 		 737 aa  320  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.63 
 
 		 796 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.47 
 
 		 726 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.76 
 
 		 732 aa  311  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  33.42 
 
 		 787 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 737 aa  310  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  37.54 
 
 		 903 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  36.15 
 
 		 958 aa  306  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.09 
 
 		 749 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.33 
 
 		 723 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  32.01 
 
 		 760 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 715 aa  300  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.81 
 
 		 876 aa  297  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  33.85 
 
 		 751 aa  296  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.85 
 
 		 740 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.66 
 
 		 750 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.52 
 
 		 781 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  37.33 
 
 		 726 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.78 
 
 		 711 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 761 aa  283  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.28 
 
 		 714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.53 
 
 		 979 aa  255  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.03 
 
 		 743 aa  253  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.5 
 
 		 983 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.5 
 
 		 983 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.31 
 
 		 758 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.99 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.92 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.01 
 
 		 730 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.15 
 
 		 730 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.23 
 
 		 730 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.94 
 
 		 968 aa  241  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.01 
 
 		 730 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.01 
 
 		 730 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.01 
 
 		 730 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.8 
 
 		 730 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.95 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 		 740 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.64 
 
 		 978 aa  236  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.77 
 
 		 846 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.86 
 
 		 730 aa  234  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.79 
 
 		 729 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.16 
 
 		 738 aa  221  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.14 
 
 		 966 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.55 
 
 		 743 aa  217  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.44 
 
 		 741 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.5 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>