More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5585 on replicon NC_009340
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  57.07 
 
 
772 aa  809    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  53.26 
 
 
784 aa  643    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  49.23 
 
 
779 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  57.07 
 
 
772 aa  809    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
787 aa  1526    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  57.07 
 
 
772 aa  810    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  43.68 
 
 
832 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  41.55 
 
 
854 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.19 
 
 
734 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  42.5 
 
 
728 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  43.96 
 
 
755 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  41.37 
 
 
737 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  42.78 
 
 
735 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  43.35 
 
 
731 aa  469  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  45.81 
 
 
723 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  43 
 
 
791 aa  462  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  41.65 
 
 
843 aa  459  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  41.23 
 
 
735 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  40.21 
 
 
779 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.36 
 
 
724 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  39.64 
 
 
787 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  39.95 
 
 
909 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  38.92 
 
 
920 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  39.3 
 
 
732 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  45.43 
 
 
958 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.8 
 
 
793 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  44.98 
 
 
734 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  48.29 
 
 
840 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  39.62 
 
 
917 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  37.13 
 
 
742 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  46.93 
 
 
1092 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 
829 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 
829 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.77 
 
 
1382 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.27 
 
 
743 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  40.31 
 
 
734 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  37.42 
 
 
1002 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32.16 
 
 
893 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.29 
 
 
760 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  38.96 
 
 
1058 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.17 
 
 
717 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  33.91 
 
 
735 aa  360  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  38.82 
 
 
729 aa  359  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.81 
 
 
842 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  37.34 
 
 
807 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  38.94 
 
 
732 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  38.58 
 
 
903 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  36.22 
 
 
758 aa  350  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.86 
 
 
737 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.56 
 
 
729 aa  344  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  46.78 
 
 
726 aa  344  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.64 
 
 
704 aa  340  5e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.42 
 
 
746 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  34.67 
 
 
752 aa  335  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.94 
 
 
718 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.34 
 
 
732 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  39.34 
 
 
903 aa  328  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  37.94 
 
 
737 aa  326  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.26 
 
 
726 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.11 
 
 
751 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.72 
 
 
735 aa  323  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  39.77 
 
 
738 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.38 
 
 
723 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.38 
 
 
749 aa  312  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  45.13 
 
 
726 aa  310  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  33.2 
 
 
715 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.38 
 
 
876 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.96 
 
 
761 aa  303  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.99 
 
 
743 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.04 
 
 
740 aa  301  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.31 
 
 
750 aa  300  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.4 
 
 
781 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  40.49 
 
 
724 aa  283  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  38.06 
 
 
714 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.88 
 
 
796 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.92 
 
 
711 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.16 
 
 
983 aa  260  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.16 
 
 
983 aa  260  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.33 
 
 
979 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.3 
 
 
978 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.73 
 
 
968 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  33.69 
 
 
836 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.9 
 
 
751 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.87 
 
 
758 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  32.63 
 
 
718 aa  217  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.14 
 
 
738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.46 
 
 
743 aa  213  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  29.73 
 
 
736 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.09 
 
 
966 aa  211  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.45 
 
 
741 aa  208  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.51 
 
 
737 aa  207  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.09 
 
 
730 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.4 
 
 
757 aa  198  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  34.13 
 
 
743 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  37.77 
 
 
776 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.94 
 
 
730 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.01 
 
 
730 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.94 
 
 
730 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.94 
 
 
730 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.64 
 
 
710 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>