More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0724 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  73.86 
 
 		 718 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  100 
 
 		 718 aa  1391    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 743 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.18 
 
 		 829 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.18 
 
 		 829 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.07 
 
 		 717 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.81 
 
 		 729 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.63 
 
 		 704 aa  253  8.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.92 
 
 		 893 aa  250  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 714 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31.22 
 
 		 751 aa  243  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.21 
 
 		 979 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  32.5 
 
 		 732 aa  241  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.06 
 
 		 740 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.13 
 
 		 983 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.13 
 
 		 983 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.44 
 
 		 735 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  31.74 
 
 		 738 aa  236  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.04 
 
 		 718 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.47 
 
 		 736 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.7 
 
 		 724 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.04 
 
 		 743 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.14 
 
 		 710 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.19 
 
 		 741 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  32.84 
 
 		 751 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.64 
 
 		 741 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  29.57 
 
 		 733 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  31.59 
 
 		 876 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.73 
 
 		 735 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  27.73 
 
 		 758 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.55 
 
 		 846 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.78 
 
 		 766 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 842 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.22 
 
 		 1155 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  29.38 
 
 		 751 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.14 
 
 		 750 aa  220  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.7 
 
 		 781 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.37 
 
 		 723 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  29.4 
 
 		 832 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.05 
 
 		 740 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.28 
 
 		 711 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  31.18 
 
 		 772 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  30.22 
 
 		 732 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  31.18 
 
 		 772 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  31.18 
 
 		 772 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.32 
 
 		 966 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  27.14 
 
 		 978 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.45 
 
 		 736 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  31.96 
 
 		 715 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  28.95 
 
 		 758 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  28.68 
 
 		 769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  28.68 
 
 		 769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.05 
 
 		 734 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  30.56 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  31.54 
 
 		 731 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.4 
 
 		 735 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.7 
 
 		 740 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.48 
 
 		 760 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.19 
 
 		 749 aa  210  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.11 
 
 		 770 aa  210  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.66 
 
 		 779 aa  210  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  30.76 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.98 
 
 		 717 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  30.85 
 
 		 761 aa  208  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.78 
 
 		 752 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.25 
 
 		 968 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  24.24 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  30.23 
 
 		 727 aa  207  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.68 
 
 		 743 aa  206  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  24.14 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.92 
 
 		 796 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.96 
 
 		 724 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  28.71 
 
 		 735 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  23.76 
 
 		 730 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.04 
 
 		 787 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  31.35 
 
 		 738 aa  205  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.02 
 
 		 723 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.25 
 
 		 726 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  24.14 
 
 		 730 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  24.14 
 
 		 730 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  28.63 
 
 		 728 aa  204  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  24.14 
 
 		 730 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  24.01 
 
 		 730 aa  204  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 731 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  29.4 
 
 		 917 aa  200  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  28.91 
 
 		 754 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  28.92 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  28.91 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  29.18 
 
 		 778 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.78 
 
 		 737 aa  198  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  30.13 
 
 		 847 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.21 
 
 		 1382 aa  197  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.04 
 
 		 738 aa  196  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  28.32 
 
 		 737 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  28.18 
 
 		 738 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  28.61 
 
 		 793 aa  194  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  29.67 
 
 		 755 aa  194  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  28.61 
 
 		 734 aa  194  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.03 
 
 		 1308 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>