More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1453 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 736 aa  1437    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  48.55 
 
 		 745 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  44.9 
 
 		 846 aa  541  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  42.78 
 
 		 743 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  39.36 
 
 		 744 aa  436  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  42.92 
 
 		 743 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  41.64 
 
 		 847 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  37.48 
 
 		 737 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  37.29 
 
 		 729 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  37.42 
 
 		 794 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.78 
 
 		 758 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.94 
 
 		 740 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.78 
 
 		 983 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.78 
 
 		 983 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.78 
 
 		 979 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.74 
 
 		 718 aa  274  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  37.19 
 
 		 978 aa  267  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.64 
 
 		 743 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.68 
 
 		 758 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  36.54 
 
 		 968 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 737 aa  256  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.82 
 
 		 717 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.03 
 
 		 741 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.9 
 
 		 723 aa  253  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.41 
 
 		 737 aa  252  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.23 
 
 		 805 aa  251  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.04 
 
 		 735 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.17 
 
 		 842 aa  249  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  38.41 
 
 		 711 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  33.54 
 
 		 766 aa  246  8e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  35.74 
 
 		 966 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.12 
 
 		 781 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.71 
 
 		 917 aa  243  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.03 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.93 
 
 		 732 aa  240  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.6 
 
 		 737 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.34 
 
 		 745 aa  239  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.83 
 
 		 723 aa  239  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.59 
 
 		 743 aa  237  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.77 
 
 		 997 aa  232  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.02 
 
 		 750 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.05 
 
 		 735 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.44 
 
 		 876 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  34.68 
 
 		 728 aa  231  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.85 
 
 		 761 aa  230  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  30.03 
 
 		 909 aa  225  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  32.47 
 
 		 755 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  30.86 
 
 		 738 aa  224  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.8 
 
 		 726 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.03 
 
 		 724 aa  223  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  32.39 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  33.73 
 
 		 717 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  31.58 
 
 		 843 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.32 
 
 		 718 aa  222  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.63 
 
 		 740 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.46 
 
 		 704 aa  222  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 		 734 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 1155 aa  221  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.96 
 
 		 752 aa  221  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.63 
 
 		 1308 aa  220  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.48 
 
 		 751 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.67 
 
 		 734 aa  220  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  32.57 
 
 		 732 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.24 
 
 		 738 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.68 
 
 		 710 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  33.88 
 
 		 793 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.58 
 
 		 770 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  30.46 
 
 		 920 aa  217  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.07 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.91 
 
 		 779 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.85 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.43 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  33.52 
 
 		 832 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.9 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  32.52 
 
 		 762 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.38 
 
 		 724 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  29.4 
 
 		 741 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  29.48 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.24 
 
 		 740 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.18 
 
 		 738 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.6 
 
 		 772 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.6 
 
 		 772 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  27.67 
 
 		 1013 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.6 
 
 		 772 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.45 
 
 		 758 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 743 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.03 
 
 		 746 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.66 
 
 		 715 aa  211  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  32.02 
 
 		 734 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  32.02 
 
 		 854 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.41 
 
 		 730 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.01 
 
 		 731 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.09 
 
 		 749 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.99 
 
 		 733 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.01 
 
 		 730 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.41 
 
 		 730 aa  208  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.41 
 
 		 730 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.41 
 
 		 730 aa  208  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.41 
 
 		 730 aa  208  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.07 
 
 		 730 aa  207  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>