More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0201 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 847 aa  1634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  49.66 
 
 		 846 aa  628  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  47.38 
 
 		 743 aa  580  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  44.53 
 
 		 744 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  49.05 
 
 		 743 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  42.49 
 
 		 745 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  42.23 
 
 		 736 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  40.39 
 
 		 737 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  38.73 
 
 		 794 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  37.6 
 
 		 729 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.54 
 
 		 743 aa  280  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.11 
 
 		 758 aa  263  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.85 
 
 		 735 aa  254  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 717 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.03 
 
 		 740 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  29.81 
 
 		 805 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 732 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.47 
 
 		 876 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.02 
 
 		 983 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.02 
 
 		 983 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.54 
 
 		 979 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  33.39 
 
 		 766 aa  239  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.39 
 
 		 978 aa  239  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.94 
 
 		 758 aa  237  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.13 
 
 		 735 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.46 
 
 		 968 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.64 
 
 		 761 aa  229  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.99 
 
 		 729 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.67 
 
 		 752 aa  227  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.74 
 
 		 718 aa  227  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.94 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  34.88 
 
 		 731 aa  223  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.34 
 
 		 743 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.26 
 
 		 966 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  30.73 
 
 		 714 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.57 
 
 		 723 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.61 
 
 		 737 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.21 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.65 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.07 
 
 		 738 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.18 
 
 		 781 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  30.2 
 
 		 779 aa  218  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  31.27 
 
 		 734 aa  218  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.54 
 
 		 724 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.86 
 
 		 944 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.68 
 
 		 743 aa  217  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.35 
 
 		 832 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.62 
 
 		 740 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 1155 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.95 
 
 		 760 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.78 
 
 		 736 aa  214  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  32.84 
 
 		 793 aa  214  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.96 
 
 		 751 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  30.17 
 
 		 741 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.76 
 
 		 758 aa  213  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  30.94 
 
 		 843 aa  212  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  32.84 
 
 		 734 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.64 
 
 		 717 aa  211  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  30.52 
 
 		 1002 aa  209  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.49 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.93 
 
 		 842 aa  207  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.53 
 
 		 1308 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  31.62 
 
 		 854 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.06 
 
 		 741 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  32.87 
 
 		 732 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.18 
 
 		 749 aa  205  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.17 
 
 		 1095 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.27 
 
 		 829 aa  204  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.27 
 
 		 829 aa  204  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.47 
 
 		 740 aa  204  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.04 
 
 		 1013 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  29.46 
 
 		 751 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  29.18 
 
 		 920 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.21 
 
 		 728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  32.76 
 
 		 718 aa  202  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.62 
 
 		 724 aa  202  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.19 
 
 		 723 aa  201  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.22 
 
 		 917 aa  200  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  28.88 
 
 		 769 aa  199  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  30.44 
 
 		 750 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  28.88 
 
 		 769 aa  199  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  32.09 
 
 		 745 aa  195  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  32.24 
 
 		 840 aa  194  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  32.2 
 
 		 724 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1092 aa  194  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.92 
 
 		 796 aa  194  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  31.2 
 
 		 779 aa  194  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.79 
 
 		 704 aa  193  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  24.19 
 
 		 730 aa  191  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.3 
 
 		 730 aa  190  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  25.88 
 
 		 997 aa  190  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  30.26 
 
 		 735 aa  190  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.89 
 
 		 893 aa  188  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  27.75 
 
 		 754 aa  188  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  27.75 
 
 		 748 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  32.64 
 
 		 958 aa  187  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  28.71 
 
 		 770 aa  188  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  30.54 
 
 		 734 aa  187  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  24.32 
 
 		 730 aa  187  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  30.24 
 
 		 1058 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>