More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10208 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  100 
 
 		 944 aa  1894    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  49.52 
 
 		 1095 aa  744    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  65.88 
 
 		 632 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  61.23 
 
 		 1013 aa  1191    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  57.21 
 
 		 1093 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  41.66 
 
 		 997 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  57.21 
 
 		 1093 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  57.53 
 
 		 1089 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  57.95 
 
 		 1110 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  40.26 
 
 		 710 aa  479  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  36.01 
 
 		 766 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  35.22 
 
 		 733 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.21 
 
 		 717 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.82 
 
 		 740 aa  357  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.08 
 
 		 1308 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 805 aa  346  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  34.6 
 
 		 731 aa  330  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  33.47 
 
 		 727 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  30.55 
 
 		 770 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  34.88 
 
 		 762 aa  317  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  32.94 
 
 		 738 aa  313  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 		 743 aa  312  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 796 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.32 
 
 		 1155 aa  308  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  30.19 
 
 		 741 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  31.31 
 
 		 751 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 758 aa  293  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.64 
 
 		 769 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.64 
 
 		 769 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  30.81 
 
 		 767 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  30.81 
 
 		 767 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.37 
 
 		 736 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  30.55 
 
 		 783 aa  279  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  30.68 
 
 		 767 aa  279  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  30.18 
 
 		 748 aa  278  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.12 
 
 		 724 aa  278  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  30.18 
 
 		 754 aa  277  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5546  RND superfamily drug efflux protein  63.04 
 
 		 243 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0356302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.73 
 
 		 738 aa  273  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  30.69 
 
 		 778 aa  269  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.08 
 
 		 761 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.92 
 
 		 741 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.39 
 
 		 757 aa  257  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.21 
 
 		 730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.08 
 
 		 730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.08 
 
 		 730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.08 
 
 		 730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  30.65 
 
 		 731 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.18 
 
 		 743 aa  253  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  25.81 
 
 		 730 aa  253  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.11 
 
 		 717 aa  251  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.08 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  33.54 
 
 		 773 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.14 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  25.55 
 
 		 730 aa  247  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.88 
 
 		 730 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  28.84 
 
 		 738 aa  243  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  25.95 
 
 		 730 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  29.36 
 
 		 953 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  29.58 
 
 		 839 aa  238  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.71 
 
 		 743 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.72 
 
 		 846 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  25.29 
 
 		 729 aa  232  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 		 718 aa  230  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.16 
 
 		 740 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.43 
 
 		 737 aa  226  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.27 
 
 		 740 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  28 
 
 		 735 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.62 
 
 		 761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  31.29 
 
 		 745 aa  218  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.33 
 
 		 979 aa  213  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  29.01 
 
 		 737 aa  211  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  26.81 
 
 		 983 aa  211  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  26.81 
 
 		 983 aa  211  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.24 
 
 		 740 aa  207  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  27.64 
 
 		 779 aa  207  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  24.67 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.12 
 
 		 743 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.18 
 
 		 724 aa  204  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.44 
 
 		 829 aa  198  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.44 
 
 		 829 aa  198  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  26.27 
 
 		 752 aa  197  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  27.16 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  30.37 
 
 		 735 aa  195  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.31 
 
 		 736 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  29.59 
 
 		 711 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  31.86 
 
 		 743 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  29.02 
 
 		 709 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.6 
 
 		 796 aa  194  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.34 
 
 		 842 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  29.91 
 
 		 847 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.38 
 
 		 741 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  30.55 
 
 		 723 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  27.22 
 
 		 737 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  27.72 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.05 
 
 		 750 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  27.55 
 
 		 978 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  27.82 
 
 		 743 aa  188  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  28.06 
 
 		 832 aa  188  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>