More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0656 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  67.29 
 
 
783 aa  864    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  50.52 
 
 
741 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
796 aa  1529    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  47.36 
 
 
773 aa  541  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  43.88 
 
 
770 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  43.35 
 
 
1155 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  44.56 
 
 
724 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  44.27 
 
 
738 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  43.41 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  45.54 
 
 
748 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  42.82 
 
 
769 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  45.54 
 
 
754 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  42.82 
 
 
769 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  45.04 
 
 
727 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  44.06 
 
 
778 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  43.69 
 
 
743 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  43.6 
 
 
736 aa  482  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  42.26 
 
 
767 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  42.26 
 
 
767 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  42.26 
 
 
767 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 
953 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.67 
 
 
740 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  41.48 
 
 
738 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  40.78 
 
 
733 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  40.95 
 
 
839 aa  439  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  38.83 
 
 
766 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  41 
 
 
731 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  41.62 
 
 
717 aa  429  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  36.88 
 
 
710 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  37.08 
 
 
740 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.26 
 
 
1308 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  36.75 
 
 
738 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  34.21 
 
 
758 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  37.29 
 
 
731 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  35.27 
 
 
805 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  38.84 
 
 
762 aa  360  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.46 
 
 
1095 aa  353  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  31.65 
 
 
1013 aa  340  8e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.35 
 
 
741 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  43.65 
 
 
500 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  31.87 
 
 
997 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.83 
 
 
738 aa  324  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.59 
 
 
944 aa  323  6e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  35.55 
 
 
743 aa  313  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  34.6 
 
 
757 aa  305  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.26 
 
 
761 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.13 
 
 
709 aa  288  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.5 
 
 
740 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.39 
 
 
730 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.25 
 
 
730 aa  278  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.25 
 
 
730 aa  277  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.25 
 
 
730 aa  277  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.25 
 
 
730 aa  277  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.25 
 
 
730 aa  277  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  33.29 
 
 
737 aa  276  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.25 
 
 
730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.47 
 
 
730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.56 
 
 
752 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.3 
 
 
730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.36 
 
 
745 aa  275  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.96 
 
 
730 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.11 
 
 
842 aa  266  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.73 
 
 
717 aa  264  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.85 
 
 
729 aa  265  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.99 
 
 
758 aa  263  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.76 
 
 
743 aa  261  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.59 
 
 
723 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.44 
 
 
735 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  34.26 
 
 
718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  33.79 
 
 
734 aa  243  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.55 
 
 
724 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.42 
 
 
711 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.1 
 
 
979 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.1 
 
 
983 aa  234  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.1 
 
 
983 aa  234  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.57 
 
 
726 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.74 
 
 
796 aa  231  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.54 
 
 
758 aa  231  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.08 
 
 
741 aa  227  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.96 
 
 
760 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.89 
 
 
761 aa  227  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.65 
 
 
734 aa  227  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  30.01 
 
 
749 aa  226  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  28.91 
 
 
737 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.2 
 
 
704 aa  225  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.02 
 
 
781 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  31.77 
 
 
832 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  30.43 
 
 
876 aa  222  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.97 
 
 
731 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.31 
 
 
743 aa  221  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.73 
 
 
978 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.92 
 
 
735 aa  221  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  31.63 
 
 
751 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.22 
 
 
723 aa  220  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.98 
 
 
751 aa  218  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.07 
 
 
829 aa  217  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.07 
 
 
829 aa  217  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  30.09 
 
 
735 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.87 
 
 
743 aa  216  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.13 
 
 
728 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>