More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1601 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.5 
 
 		 1382 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  100 
 
 		 779 aa  1550    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  47.07 
 
 		 832 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  48.03 
 
 		 755 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  46.95 
 
 		 734 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  45.71 
 
 		 723 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  45.34 
 
 		 728 aa  551  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  45.51 
 
 		 731 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  43.88 
 
 		 746 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  43.01 
 
 		 779 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  42.88 
 
 		 737 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  43.92 
 
 		 735 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  44.25 
 
 		 735 aa  512  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  45.62 
 
 		 724 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  42.66 
 
 		 793 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  40.62 
 
 		 787 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.48 
 
 		 772 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.48 
 
 		 772 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  40.48 
 
 		 772 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  40.15 
 
 		 909 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.46 
 
 		 920 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  42.88 
 
 		 734 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.06 
 
 		 829 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.06 
 
 		 829 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  39.67 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  39.69 
 
 		 840 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  42.71 
 
 		 734 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  37.17 
 
 		 742 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  38.93 
 
 		 917 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  35.47 
 
 		 893 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  39.33 
 
 		 1002 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  43.13 
 
 		 843 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  35.91 
 
 		 854 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  41.28 
 
 		 729 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.94 
 
 		 704 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  40.07 
 
 		 791 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  39.56 
 
 		 1058 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  38.33 
 
 		 958 aa  398  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  40.21 
 
 		 787 aa  399  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  39.92 
 
 		 903 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.53 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  38.34 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  42.47 
 
 		 738 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  36.15 
 
 		 735 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.63 
 
 		 1092 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  39.35 
 
 		 732 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.36 
 
 		 737 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  40.32 
 
 		 903 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  42.45 
 
 		 726 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  37.2 
 
 		 807 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.4 
 
 		 760 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.35 
 
 		 717 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  33.9 
 
 		 842 aa  360  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.92 
 
 		 729 aa  356  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.08 
 
 		 735 aa  353  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  33.51 
 
 		 718 aa  352  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  42.16 
 
 		 726 aa  348  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.29 
 
 		 740 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  34.61 
 
 		 752 aa  342  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.5 
 
 		 732 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.43 
 
 		 726 aa  337  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.23 
 
 		 758 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.36 
 
 		 723 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  44.64 
 
 		 737 aa  330  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.79 
 
 		 876 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.51 
 
 		 749 aa  320  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.46 
 
 		 761 aa  319  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.77 
 
 		 711 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.57 
 
 		 796 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.42 
 
 		 715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.38 
 
 		 750 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.2 
 
 		 781 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.07 
 
 		 751 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.77 
 
 		 743 aa  296  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  32.84 
 
 		 714 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  36.5 
 
 		 836 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.6 
 
 		 979 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.6 
 
 		 983 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.6 
 
 		 983 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  30 
 
 		 730 aa  237  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.68 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.25 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  26.96 
 
 		 997 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.2 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  29.68 
 
 		 730 aa  229  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.06 
 
 		 738 aa  229  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.5 
 
 		 740 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.35 
 
 		 730 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  29.35 
 
 		 730 aa  227  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.26 
 
 		 730 aa  227  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.35 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.35 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.35 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.81 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.66 
 
 		 978 aa  226  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.76 
 
 		 729 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  30.2 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.06 
 
 		 968 aa  219  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  31.62 
 
 		 734 aa  218  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.62 
 
 		 710 aa  216  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>