More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0993 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  72.05 
 
 		 726 aa  837    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  61.2 
 
 		 738 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  68.04 
 
 		 729 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  100 
 
 		 734 aa  1410    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  63.09 
 
 		 726 aa  626  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  52.05 
 
 		 723 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  50.74 
 
 		 731 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  50.07 
 
 		 832 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  48.64 
 
 		 734 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  51.35 
 
 		 1058 aa  558  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  49.59 
 
 		 755 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  48.27 
 
 		 728 aa  552  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  49.45 
 
 		 737 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  47.32 
 
 		 793 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  47.72 
 
 		 735 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  48.85 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  48.18 
 
 		 735 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  47.43 
 
 		 734 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  45.98 
 
 		 807 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  36.97 
 
 		 829 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  36.97 
 
 		 829 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  42.66 
 
 		 920 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  42.97 
 
 		 779 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  44.71 
 
 		 787 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  46.14 
 
 		 732 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  42.97 
 
 		 779 aa  468  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  37.09 
 
 		 893 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  40.86 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  40.86 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  41.1 
 
 		 772 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  42.22 
 
 		 732 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  41.92 
 
 		 909 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  44.69 
 
 		 737 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  41.95 
 
 		 1002 aa  416  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  47.4 
 
 		 854 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  40.48 
 
 		 917 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.42 
 
 		 1382 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  44.08 
 
 		 903 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  38.06 
 
 		 742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  39.36 
 
 		 791 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.32 
 
 		 746 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.73 
 
 		 735 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  37.3 
 
 		 760 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1092 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  35.12 
 
 		 704 aa  392  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  35.92 
 
 		 743 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  41.68 
 
 		 958 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  41.69 
 
 		 784 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  38.6 
 
 		 752 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  44.62 
 
 		 903 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.46 
 
 		 842 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  39.79 
 
 		 787 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  45.52 
 
 		 843 aa  361  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  45.45 
 
 		 840 aa  357  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.48 
 
 		 732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  38 
 
 		 758 aa  353  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  36.89 
 
 		 726 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.91 
 
 		 729 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.58 
 
 		 717 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.03 
 
 		 735 aa  337  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  34.31 
 
 		 718 aa  334  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.91 
 
 		 749 aa  331  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  37.03 
 
 		 876 aa  330  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 		 715 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.53 
 
 		 737 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.57 
 
 		 724 aa  320  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.72 
 
 		 796 aa  318  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.17 
 
 		 781 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.04 
 
 		 711 aa  311  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.33 
 
 		 751 aa  310  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.09 
 
 		 714 aa  296  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.33 
 
 		 723 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.98 
 
 		 750 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.99 
 
 		 740 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.84 
 
 		 761 aa  273  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  34.99 
 
 		 743 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  36.46 
 
 		 836 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.94 
 
 		 978 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.63 
 
 		 979 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.8 
 
 		 983 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.8 
 
 		 983 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.43 
 
 		 966 aa  240  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 846 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.04 
 
 		 968 aa  236  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.06 
 
 		 740 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.02 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  34.47 
 
 		 734 aa  224  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.59 
 
 		 766 aa  224  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.95 
 
 		 743 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.31 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.15 
 
 		 738 aa  220  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.72 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.08 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.15 
 
 		 736 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  30.27 
 
 		 796 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  28.19 
 
 		 710 aa  210  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.05 
 
 		 751 aa  209  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.72 
 
 		 717 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.58 
 
 		 737 aa  208  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.83 
 
 		 741 aa  207  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>