More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0676 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  52.27 
 
 		 770 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  50.71 
 
 		 769 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  100 
 
 		 736 aa  1444    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  58.53 
 
 		 738 aa  769    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  50.71 
 
 		 769 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  51.22 
 
 		 1155 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  51.72 
 
 		 751 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  50.73 
 
 		 738 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  52.29 
 
 		 778 aa  635  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  51.87 
 
 		 748 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  51.87 
 
 		 754 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  49.01 
 
 		 767 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  49.01 
 
 		 767 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  49.01 
 
 		 767 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  50 
 
 		 743 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  51.17 
 
 		 727 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  46.27 
 
 		 731 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  44.15 
 
 		 796 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  40.14 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  42.78 
 
 		 773 aa  452  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  41.07 
 
 		 783 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  40.45 
 
 		 733 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  55.03 
 
 		 500 aa  436  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.11 
 
 		 724 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  38.5 
 
 		 766 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  37.02 
 
 		 710 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.62 
 
 		 740 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  39.52 
 
 		 717 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  38.01 
 
 		 839 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.86 
 
 		 740 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  37.21 
 
 		 953 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.72 
 
 		 1308 aa  363  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  35.01 
 
 		 805 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.22 
 
 		 758 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  34.72 
 
 		 738 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  36.35 
 
 		 731 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.52 
 
 		 741 aa  328  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.81 
 
 		 738 aa  326  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.99 
 
 		 761 aa  303  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  35.77 
 
 		 762 aa  303  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.68 
 
 		 1095 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  30.79 
 
 		 1013 aa  295  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.87 
 
 		 743 aa  286  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.21 
 
 		 730 aa  270  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.98 
 
 		 730 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.98 
 
 		 730 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.98 
 
 		 730 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.75 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.37 
 
 		 730 aa  269  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.83 
 
 		 730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.89 
 
 		 997 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.65 
 
 		 944 aa  265  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.99 
 
 		 730 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.83 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.56 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.87 
 
 		 740 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  31.18 
 
 		 757 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.95 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.22 
 
 		 979 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.22 
 
 		 983 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.51 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.22 
 
 		 983 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.3 
 
 		 729 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32 
 
 		 735 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.91 
 
 		 752 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.19 
 
 		 968 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.22 
 
 		 717 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.37 
 
 		 723 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 741 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.96 
 
 		 832 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.44 
 
 		 842 aa  237  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.72 
 
 		 745 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  30.44 
 
 		 728 aa  232  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  33.79 
 
 		 709 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.01 
 
 		 978 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.52 
 
 		 966 aa  230  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.16 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.38 
 
 		 829 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.38 
 
 		 829 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.18 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  34.91 
 
 		 731 aa  224  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30 
 
 		 718 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.45 
 
 		 726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  28.86 
 
 		 734 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.27 
 
 		 704 aa  217  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  31.52 
 
 		 744 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.62 
 
 		 796 aa  217  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.72 
 
 		 893 aa  216  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  35.52 
 
 		 758 aa  216  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  31.1 
 
 		 734 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  30.96 
 
 		 793 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.45 
 
 		 718 aa  214  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.17 
 
 		 737 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 846 aa  214  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  30.08 
 
 		 760 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  31.14 
 
 		 732 aa  210  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  30.12 
 
 		 732 aa  208  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.41 
 
 		 781 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.4 
 
 		 740 aa  205  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  30.39 
 
 		 749 aa  205  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>