More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1912 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  100 
 
 		 731 aa  1419    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  62.64 
 
 		 738 aa  822    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  45.95 
 
 		 733 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  47.17 
 
 		 717 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  43.49 
 
 		 740 aa  558  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  46.3 
 
 		 1308 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  47.12 
 
 		 762 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  42.9 
 
 		 766 aa  515  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  41.75 
 
 		 805 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  39.94 
 
 		 710 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  37.81 
 
 		 758 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  37.5 
 
 		 741 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39 
 
 		 724 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  37.22 
 
 		 796 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.5 
 
 		 1095 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  36.54 
 
 		 727 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  37.18 
 
 		 738 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  35.19 
 
 		 770 aa  369  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  36.27 
 
 		 751 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.91 
 
 		 740 aa  363  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  36.15 
 
 		 736 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  35.43 
 
 		 769 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  35.43 
 
 		 769 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  39.44 
 
 		 743 aa  359  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 1155 aa  358  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  38.51 
 
 		 839 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.62 
 
 		 738 aa  356  8.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.81 
 
 		 741 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  34.6 
 
 		 944 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  32.55 
 
 		 1013 aa  350  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  36.91 
 
 		 953 aa  346  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  35.22 
 
 		 783 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  35.63 
 
 		 767 aa  341  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  35.51 
 
 		 767 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  35.51 
 
 		 767 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  35.6 
 
 		 743 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  34.86 
 
 		 748 aa  338  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  34.86 
 
 		 754 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  36.16 
 
 		 738 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  37.94 
 
 		 757 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.39 
 
 		 761 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.42 
 
 		 997 aa  326  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  36.2 
 
 		 778 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 		 731 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  35.13 
 
 		 758 aa  300  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.95 
 
 		 730 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  30.31 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  30.31 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.17 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  30.47 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  30.31 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.18 
 
 		 730 aa  294  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.18 
 
 		 730 aa  294  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  32.3 
 
 		 730 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  32.14 
 
 		 730 aa  290  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.86 
 
 		 983 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.86 
 
 		 983 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.86 
 
 		 979 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  35 
 
 		 709 aa  281  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.94 
 
 		 740 aa  272  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.01 
 
 		 978 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.55 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.89 
 
 		 737 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.93 
 
 		 781 aa  267  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.41 
 
 		 968 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.65 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.3 
 
 		 740 aa  261  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  36.71 
 
 		 741 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  35.96 
 
 		 751 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 842 aa  258  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  30.76 
 
 		 749 aa  253  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  36.99 
 
 		 745 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.54 
 
 		 717 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.84 
 
 		 743 aa  246  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.73 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  36.46 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.56 
 
 		 966 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  39.63 
 
 		 773 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.47 
 
 		 704 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.28 
 
 		 735 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.93 
 
 		 846 aa  237  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.83 
 
 		 743 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.27 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.22 
 
 		 732 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  31.94 
 
 		 632 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  32.62 
 
 		 734 aa  230  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.41 
 
 		 750 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.01 
 
 		 734 aa  229  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.84 
 
 		 829 aa  228  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.84 
 
 		 829 aa  228  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.1 
 
 		 724 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.39 
 
 		 796 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.13 
 
 		 726 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  31.18 
 
 		 736 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.6 
 
 		 752 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.85 
 
 		 761 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.79 
 
 		 723 aa  221  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.87 
 
 		 743 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.09 
 
 		 711 aa  220  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.31 
 
 		 893 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>