More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2652 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  100 
 
 		 751 aa  1461    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.55 
 
 		 741 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.16 
 
 		 743 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  35.97 
 
 		 733 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.32 
 
 		 735 aa  324  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.17 
 
 		 758 aa  310  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.16 
 
 		 758 aa  308  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.92 
 
 		 983 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.92 
 
 		 983 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.77 
 
 		 842 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.92 
 
 		 979 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.08 
 
 		 743 aa  303  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31.98 
 
 		 740 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  30.53 
 
 		 718 aa  301  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  35.07 
 
 		 717 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  34.76 
 
 		 978 aa  298  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.96 
 
 		 731 aa  296  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.53 
 
 		 796 aa  296  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  33.15 
 
 		 752 aa  294  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  32.62 
 
 		 737 aa  293  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.58 
 
 		 805 aa  291  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.78 
 
 		 968 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  34.69 
 
 		 718 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.66 
 
 		 766 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.79 
 
 		 743 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  34.02 
 
 		 735 aa  282  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  33.78 
 
 		 734 aa  281  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.65 
 
 		 717 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.17 
 
 		 829 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.17 
 
 		 829 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  36.24 
 
 		 731 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  33.43 
 
 		 743 aa  276  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.78 
 
 		 729 aa  276  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.36 
 
 		 846 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 735 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.14 
 
 		 714 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  32.46 
 
 		 738 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 760 aa  273  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.45 
 
 		 966 aa  273  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  33.43 
 
 		 741 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.58 
 
 		 740 aa  272  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  33.52 
 
 		 832 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  35.08 
 
 		 781 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.68 
 
 		 730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.85 
 
 		 728 aa  270  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.44 
 
 		 1308 aa  270  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.78 
 
 		 735 aa  269  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  31.81 
 
 		 920 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 		 755 aa  268  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.97 
 
 		 758 aa  267  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  34.02 
 
 		 724 aa  267  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.22 
 
 		 729 aa  266  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  31.74 
 
 		 909 aa  266  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  30.67 
 
 		 742 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.09 
 
 		 893 aa  265  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.45 
 
 		 730 aa  263  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.45 
 
 		 730 aa  263  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.45 
 
 		 730 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.48 
 
 		 730 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.76 
 
 		 723 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  32.69 
 
 		 736 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 917 aa  263  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.27 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.06 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.84 
 
 		 740 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.9 
 
 		 730 aa  260  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.82 
 
 		 738 aa  260  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  35.36 
 
 		 796 aa  260  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  31.97 
 
 		 732 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  35.33 
 
 		 724 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  32.07 
 
 		 736 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  32.42 
 
 		 779 aa  258  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.48 
 
 		 724 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.61 
 
 		 730 aa  258  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 718 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.02 
 
 		 726 aa  255  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  31.72 
 
 		 757 aa  255  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 787 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.11 
 
 		 876 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.7 
 
 		 711 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.43 
 
 		 737 aa  251  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 794 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.87 
 
 		 710 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.96 
 
 		 1155 aa  247  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  30.79 
 
 		 737 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.68 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  31.65 
 
 		 727 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  32.56 
 
 		 731 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  32.92 
 
 		 745 aa  245  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.89 
 
 		 761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.07 
 
 		 741 aa  244  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.97 
 
 		 723 aa  244  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  31.08 
 
 		 748 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.51 
 
 		 715 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  30.94 
 
 		 754 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  32.08 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  31.75 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.29 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.98 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>