More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1953 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  52.71 
 
 		 735 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  49.27 
 
 		 737 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  100 
 
 		 760 aa  1513    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  48.03 
 
 		 758 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  45.98 
 
 		 752 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  47.48 
 
 		 749 aa  612  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  42.05 
 
 		 781 aa  524  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  41.45 
 
 		 717 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  42.82 
 
 		 726 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.56 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  39.75 
 
 		 718 aa  459  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.16 
 
 		 842 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.64 
 
 		 729 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  38.87 
 
 		 731 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  40.49 
 
 		 724 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  37.66 
 
 		 876 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.78 
 
 		 735 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  37.57 
 
 		 723 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  38.57 
 
 		 832 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 		 829 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  37.4 
 
 		 737 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 		 829 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  35.09 
 
 		 920 aa  399  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  34.7 
 
 		 742 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  34.7 
 
 		 787 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.4 
 
 		 751 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  36.71 
 
 		 755 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  37.37 
 
 		 734 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  36.78 
 
 		 793 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  34.96 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  36.4 
 
 		 728 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  36.78 
 
 		 734 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  37.88 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  34.4 
 
 		 779 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  35.49 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  39.07 
 
 		 729 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  36.27 
 
 		 735 aa  376  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  33.46 
 
 		 779 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  35.01 
 
 		 909 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  36.94 
 
 		 1058 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  35 
 
 		 917 aa  369  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  36.56 
 
 		 723 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.94 
 
 		 761 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  36.36 
 
 		 715 aa  364  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 		 772 aa  359  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.86 
 
 		 772 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 		 772 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.61 
 
 		 704 aa  356  8.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  38.01 
 
 		 724 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  35.72 
 
 		 735 aa  355  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  37.68 
 
 		 726 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  36.27 
 
 		 807 aa  347  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.34 
 
 		 893 aa  346  7e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  41.65 
 
 		 1092 aa  345  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  38.08 
 
 		 854 aa  346  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.51 
 
 		 743 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.6 
 
 		 787 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.07 
 
 		 740 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.29 
 
 		 791 aa  340  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.73 
 
 		 796 aa  339  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  32.56 
 
 		 958 aa  338  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.75 
 
 		 1002 aa  336  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  38.87 
 
 		 738 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  37.42 
 
 		 840 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  36.47 
 
 		 737 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  36.65 
 
 		 843 aa  324  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  35.17 
 
 		 903 aa  323  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.92 
 
 		 714 aa  323  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  33.98 
 
 		 732 aa  321  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  40.2 
 
 		 726 aa  317  7e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.77 
 
 		 1382 aa  316  9e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  33.11 
 
 		 784 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.88 
 
 		 746 aa  308  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  31.72 
 
 		 750 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 758 aa  287  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.23 
 
 		 983 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.23 
 
 		 983 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.23 
 
 		 979 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.35 
 
 		 711 aa  284  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.02 
 
 		 978 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  30.42 
 
 		 740 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 733 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  39.95 
 
 		 841 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.59 
 
 		 968 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  32.81 
 
 		 734 aa  256  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.14 
 
 		 966 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  28.99 
 
 		 766 aa  247  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.12 
 
 		 741 aa  244  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  40.65 
 
 		 776 aa  243  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.58 
 
 		 717 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.67 
 
 		 751 aa  236  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  28.72 
 
 		 710 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 846 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.44 
 
 		 743 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  30.32 
 
 		 836 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.79 
 
 		 770 aa  230  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 736 aa  230  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.89 
 
 		 796 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.57 
 
 		 738 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  27.17 
 
 		 744 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>