More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6914 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  100 
 
 		 724 aa  1394    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  54.11 
 
 		 723 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  55.01 
 
 		 832 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  56.96 
 
 		 728 aa  686    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  71.51 
 
 		 735 aa  944    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  54.95 
 
 		 755 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  54.03 
 
 		 734 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  70.83 
 
 		 735 aa  921    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  54.69 
 
 		 731 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  53.43 
 
 		 737 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  51.44 
 
 		 793 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  50.95 
 
 		 734 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  49.8 
 
 		 787 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  46.01 
 
 		 779 aa  562  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  45.62 
 
 		 779 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  44.52 
 
 		 742 aa  542  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  45.78 
 
 		 732 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  50.28 
 
 		 729 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  44.35 
 
 		 920 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 		 772 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  45.4 
 
 		 772 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 		 772 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  48.85 
 
 		 734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  44.81 
 
 		 909 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  46.96 
 
 		 1002 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  45.24 
 
 		 917 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  48.44 
 
 		 1058 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  51.19 
 
 		 726 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  44.47 
 
 		 791 aa  485  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  44.63 
 
 		 784 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  46.69 
 
 		 903 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.65 
 
 		 1382 aa  475  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  48.95 
 
 		 738 aa  472  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  36.59 
 
 		 829 aa  465  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  36.59 
 
 		 829 aa  465  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  43.15 
 
 		 746 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  46.4 
 
 		 843 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  44.15 
 
 		 787 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  47.72 
 
 		 903 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  47.66 
 
 		 840 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  41.05 
 
 		 842 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  43.69 
 
 		 807 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  47.07 
 
 		 854 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.89 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  37.03 
 
 		 893 aa  439  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  40.11 
 
 		 735 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  45.2 
 
 		 732 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  40.16 
 
 		 752 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  48.03 
 
 		 1092 aa  419  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  40.83 
 
 		 729 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  49.11 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  35.39 
 
 		 704 aa  412  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  43.28 
 
 		 737 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37 
 
 		 735 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.44 
 
 		 732 aa  402  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  39.49 
 
 		 717 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  36.81 
 
 		 758 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  37.5 
 
 		 737 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  40.62 
 
 		 876 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.83 
 
 		 718 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  41.26 
 
 		 958 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.96 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  37.09 
 
 		 760 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  39.61 
 
 		 726 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  39.64 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  36.05 
 
 		 740 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  39.06 
 
 		 714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  38.74 
 
 		 715 aa  354  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  37.09 
 
 		 750 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.33 
 
 		 796 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.31 
 
 		 761 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.2 
 
 		 749 aa  337  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  39.76 
 
 		 724 aa  336  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  37.4 
 
 		 836 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  38.72 
 
 		 711 aa  333  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  38.08 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  33.6 
 
 		 781 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.61 
 
 		 978 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.77 
 
 		 966 aa  266  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.81 
 
 		 968 aa  266  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.43 
 
 		 979 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  29.97 
 
 		 758 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.16 
 
 		 983 aa  260  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.16 
 
 		 983 aa  260  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  35.55 
 
 		 734 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.15 
 
 		 743 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  32.36 
 
 		 733 aa  251  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.61 
 
 		 751 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.39 
 
 		 710 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.99 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.01 
 
 		 738 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.44 
 
 		 741 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.95 
 
 		 846 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  33.19 
 
 		 743 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.04 
 
 		 741 aa  221  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.16 
 
 		 724 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.29 
 
 		 743 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.7 
 
 		 737 aa  218  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.33 
 
 		 745 aa  218  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>