More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1275 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  79.28 
 
 
840 aa  1200    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  100 
 
 
843 aa  1663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  45.5 
 
 
854 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  44.61 
 
 
958 aa  704    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  46.57 
 
 
791 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  49.72 
 
 
1092 aa  600  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  41.35 
 
 
772 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  41.35 
 
 
772 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  41.35 
 
 
772 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  41.63 
 
 
779 aa  502  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  48.71 
 
 
735 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  49.51 
 
 
735 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  45.26 
 
 
734 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  47.49 
 
 
728 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  45.75 
 
 
787 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  47.93 
 
 
731 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  38.35 
 
 
779 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  45.87 
 
 
737 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  47.77 
 
 
832 aa  482  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  49.1 
 
 
723 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  40.41 
 
 
784 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  41 
 
 
787 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  52.59 
 
 
755 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  42.55 
 
 
920 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  46.4 
 
 
724 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  44.78 
 
 
909 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  43.34 
 
 
793 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  43.51 
 
 
734 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  46.11 
 
 
1002 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  38.67 
 
 
829 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  38.67 
 
 
829 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.19 
 
 
1382 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  38.21 
 
 
893 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  41.9 
 
 
732 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  43.64 
 
 
917 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  40.38 
 
 
742 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  44.43 
 
 
903 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.65 
 
 
746 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  45.4 
 
 
903 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  45.07 
 
 
734 aa  375  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  42.02 
 
 
729 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  40.88 
 
 
807 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  43.46 
 
 
1058 aa  360  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  43.95 
 
 
726 aa  360  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  35.06 
 
 
743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.69 
 
 
842 aa  357  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.34 
 
 
729 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  42.02 
 
 
732 aa  352  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.6 
 
 
735 aa  348  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.15 
 
 
704 aa  348  3e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.35 
 
 
760 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.75 
 
 
718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.81 
 
 
735 aa  333  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  41.12 
 
 
738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  45.63 
 
 
737 aa  324  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  43.78 
 
 
726 aa  318  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.59 
 
 
732 aa  317  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.33 
 
 
737 aa  317  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.79 
 
 
723 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.95 
 
 
751 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  34.81 
 
 
717 aa  310  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  37.95 
 
 
726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  39.64 
 
 
752 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.77 
 
 
749 aa  303  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.81 
 
 
781 aa  302  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  35.13 
 
 
876 aa  296  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.98 
 
 
715 aa  296  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.17 
 
 
758 aa  293  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.93 
 
 
761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.01 
 
 
714 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.3 
 
 
711 aa  278  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.96 
 
 
740 aa  274  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.5 
 
 
983 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.5 
 
 
983 aa  271  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.5 
 
 
979 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.09 
 
 
750 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.06 
 
 
796 aa  263  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.64 
 
 
724 aa  260  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.96 
 
 
743 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.68 
 
 
978 aa  260  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.93 
 
 
968 aa  244  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.35 
 
 
758 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.13 
 
 
743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  31.2 
 
 
736 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.53 
 
 
966 aa  234  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.08 
 
 
741 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  34.5 
 
 
836 aa  230  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.95 
 
 
737 aa  229  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.54 
 
 
757 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  29.92 
 
 
736 aa  216  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
846 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.07 
 
 
730 aa  210  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.07 
 
 
730 aa  210  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.9 
 
 
730 aa  209  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.9 
 
 
730 aa  209  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.9 
 
 
730 aa  209  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.21 
 
 
766 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.54 
 
 
730 aa  207  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.64 
 
 
743 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.9 
 
 
730 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>