More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2662 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  100 
 
 
749 aa  1456    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  47.05 
 
 
760 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  44.2 
 
 
735 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  42.93 
 
 
737 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  41.32 
 
 
752 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39.97 
 
 
758 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  38.06 
 
 
717 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  36.89 
 
 
781 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  35.05 
 
 
920 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  37.05 
 
 
718 aa  366  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  37.76 
 
 
726 aa  366  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  31.73 
 
 
893 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  31.24 
 
 
829 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  31.24 
 
 
829 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  36.13 
 
 
732 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.69 
 
 
743 aa  348  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  34.87 
 
 
787 aa  347  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  35.54 
 
 
735 aa  344  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  38.1 
 
 
724 aa  344  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.59 
 
 
842 aa  343  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  36.43 
 
 
728 aa  341  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.55 
 
 
729 aa  336  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  36.54 
 
 
731 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.51 
 
 
779 aa  334  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  34.83 
 
 
734 aa  333  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  35.86 
 
 
735 aa  332  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.37 
 
 
704 aa  331  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  36.48 
 
 
832 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.57 
 
 
761 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  36.02 
 
 
734 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  35.88 
 
 
793 aa  324  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  35.15 
 
 
714 aa  323  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.7 
 
 
735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  35.47 
 
 
737 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.88 
 
 
723 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  33.43 
 
 
917 aa  312  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.73 
 
 
742 aa  310  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  32.22 
 
 
909 aa  310  5e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.95 
 
 
743 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.5 
 
 
791 aa  308  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  35.08 
 
 
734 aa  303  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  33.78 
 
 
1002 aa  302  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  33.84 
 
 
755 aa  302  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  36.39 
 
 
724 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.95 
 
 
854 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  34.24 
 
 
1058 aa  297  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.37 
 
 
772 aa  297  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.37 
 
 
772 aa  297  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.37 
 
 
772 aa  297  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.89 
 
 
746 aa  293  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  33.98 
 
 
807 aa  290  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  35.25 
 
 
729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.67 
 
 
740 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  32.14 
 
 
876 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  36.71 
 
 
1092 aa  281  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.14 
 
 
732 aa  281  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  35.57 
 
 
779 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  36.3 
 
 
840 aa  280  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  35.14 
 
 
843 aa  278  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  35.41 
 
 
737 aa  276  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  34.05 
 
 
958 aa  275  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 
751 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.89 
 
 
750 aa  273  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  35.45 
 
 
903 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  33.52 
 
 
732 aa  267  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.2 
 
 
723 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  31.14 
 
 
1382 aa  264  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  32.93 
 
 
738 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.48 
 
 
711 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.07 
 
 
740 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  34.98 
 
 
726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34 
 
 
983 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34 
 
 
983 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34 
 
 
979 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.01 
 
 
758 aa  254  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  37.43 
 
 
787 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  31.42 
 
 
715 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  35.67 
 
 
738 aa  248  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.9 
 
 
731 aa  244  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.56 
 
 
733 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  34.97 
 
 
784 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.65 
 
 
978 aa  240  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  33.18 
 
 
903 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.61 
 
 
738 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.2 
 
 
741 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.75 
 
 
730 aa  234  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  29.61 
 
 
710 aa  233  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.58 
 
 
968 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.75 
 
 
730 aa  231  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.75 
 
 
730 aa  230  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.75 
 
 
730 aa  230  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.75 
 
 
730 aa  230  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.53 
 
 
730 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  28.65 
 
 
743 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.89 
 
 
717 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.03 
 
 
741 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.99 
 
 
730 aa  226  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.75 
 
 
730 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.07 
 
 
730 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  29.19 
 
 
846 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>