More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3269 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 832 aa  1616    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  61.3 
 
 		 723 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  54.72 
 
 		 734 aa  709    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  58.17 
 
 		 728 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  55.29 
 
 		 734 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  56.38 
 
 		 731 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  66.62 
 
 		 755 aa  822    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  56.64 
 
 		 737 aa  706    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  55.57 
 
 		 793 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  52.16 
 
 		 735 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  52.16 
 
 		 735 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  55.01 
 
 		 724 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  47.34 
 
 		 779 aa  602  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  46.34 
 
 		 787 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  45.49 
 
 		 742 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  50.07 
 
 		 734 aa  555  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  46.13 
 
 		 732 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  44.95 
 
 		 772 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  44.95 
 
 		 772 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  45.24 
 
 		 772 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  45.43 
 
 		 920 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  48.35 
 
 		 729 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.07 
 
 		 1382 aa  519  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  37.57 
 
 		 829 aa  515  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  50.08 
 
 		 779 aa  515  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  37.57 
 
 		 829 aa  515  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  44.46 
 
 		 909 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  42.36 
 
 		 743 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  44.14 
 
 		 917 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.71 
 
 		 746 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  43.36 
 
 		 784 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  44.42 
 
 		 1002 aa  482  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  37.28 
 
 		 893 aa  478  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  46.69 
 
 		 903 aa  477  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  47.29 
 
 		 854 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  48.84 
 
 		 726 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  43.68 
 
 		 787 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  41.79 
 
 		 791 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  44.05 
 
 		 836 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  45.69 
 
 		 958 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  36.47 
 
 		 704 aa  450  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  40.32 
 
 		 729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  47.95 
 
 		 903 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  38.84 
 
 		 735 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  48.78 
 
 		 840 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  40.72 
 
 		 842 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  47.14 
 
 		 738 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  45 
 
 		 732 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  47.77 
 
 		 843 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  43.41 
 
 		 752 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  44.49 
 
 		 1058 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  39.66 
 
 		 717 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  41.46 
 
 		 723 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  46.78 
 
 		 1092 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  48.98 
 
 		 726 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.97 
 
 		 732 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  40.08 
 
 		 876 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  41.17 
 
 		 807 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.8 
 
 		 735 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  38.37 
 
 		 760 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  41.76 
 
 		 737 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  39.11 
 
 		 737 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  39.11 
 
 		 758 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 		 751 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  40.42 
 
 		 726 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  38.91 
 
 		 718 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.35 
 
 		 796 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  39 
 
 		 715 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  37.05 
 
 		 740 aa  363  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  39.44 
 
 		 711 aa  357  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  41.29 
 
 		 724 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  36.48 
 
 		 750 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  39.7 
 
 		 761 aa  351  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  36.4 
 
 		 749 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.72 
 
 		 743 aa  333  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.88 
 
 		 781 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  37.45 
 
 		 714 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  37.94 
 
 		 734 aa  314  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  37.93 
 
 		 978 aa  281  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.52 
 
 		 983 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.52 
 
 		 983 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.97 
 
 		 979 aa  279  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.51 
 
 		 968 aa  271  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.65 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  34.28 
 
 		 846 aa  258  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31 
 
 		 743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  30.48 
 
 		 1155 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.19 
 
 		 758 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.53 
 
 		 736 aa  250  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  47.95 
 
 		 776 aa  250  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 		 733 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.43 
 
 		 966 aa  247  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.57 
 
 		 741 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  31.41 
 
 		 766 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  29.88 
 
 		 751 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  35.01 
 
 		 732 aa  237  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.23 
 
 		 717 aa  237  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  32.07 
 
 		 727 aa  237  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  31.84 
 
 		 770 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  32.26 
 
 		 731 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>