More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3328 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  52.29 
 
 		 917 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  53.45 
 
 		 1002 aa  733    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  49.57 
 
 		 909 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 903 aa  1757    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  76.94 
 
 		 903 aa  1160    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  48.59 
 
 		 920 aa  609  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  48.55 
 
 		 734 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  46.75 
 
 		 737 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  46.76 
 
 		 728 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  46.51 
 
 		 731 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  46.5 
 
 		 832 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  46.2 
 
 		 755 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  46.04 
 
 		 723 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  46.69 
 
 		 724 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  44.62 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  42.72 
 
 		 735 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  42.72 
 
 		 735 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  43.07 
 
 		 793 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  39.92 
 
 		 779 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  43.35 
 
 		 734 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  44.11 
 
 		 729 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  41.04 
 
 		 742 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  39.61 
 
 		 772 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  39.61 
 
 		 772 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  39.61 
 
 		 772 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.71 
 
 		 732 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  43.91 
 
 		 734 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.08 
 
 		 743 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.14 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.14 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  39.51 
 
 		 779 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  35.16 
 
 		 893 aa  411  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  45.39 
 
 		 726 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  44.43 
 
 		 843 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  39.59 
 
 		 784 aa  396  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.67 
 
 		 842 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  38.03 
 
 		 791 aa  389  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  44.9 
 
 		 738 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.1 
 
 		 746 aa  386  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  40.96 
 
 		 807 aa  379  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  37.37 
 
 		 752 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  43.2 
 
 		 840 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.38 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.39 
 
 		 729 aa  376  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  39.88 
 
 		 958 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  40.26 
 
 		 854 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  37.92 
 
 		 1058 aa  365  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.1 
 
 		 717 aa  359  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.35 
 
 		 1382 aa  359  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.66 
 
 		 876 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.18 
 
 		 735 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.21 
 
 		 796 aa  357  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  36.64 
 
 		 723 aa  357  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  38.2 
 
 		 787 aa  356  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.38 
 
 		 735 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  36.16 
 
 		 758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  36.03 
 
 		 715 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.76 
 
 		 718 aa  352  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  41.49 
 
 		 1092 aa  350  6e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  36.46 
 
 		 732 aa  346  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  39.42 
 
 		 732 aa  344  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  45.92 
 
 		 726 aa  343  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  38.27 
 
 		 751 aa  343  8e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  34.59 
 
 		 760 aa  341  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.8 
 
 		 726 aa  338  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  38.32 
 
 		 737 aa  325  3e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  35.05 
 
 		 740 aa  323  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  34.39 
 
 		 737 aa  321  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 749 aa  312  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  37.89 
 
 		 743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.28 
 
 		 711 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.2 
 
 		 781 aa  301  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.45 
 
 		 761 aa  301  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  35.27 
 
 		 750 aa  297  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.8 
 
 		 724 aa  282  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.54 
 
 		 714 aa  266  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  33.1 
 
 		 836 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.13 
 
 		 730 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.47 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.59 
 
 		 743 aa  246  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  34.53 
 
 		 734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  26.06 
 
 		 730 aa  244  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.56 
 
 		 738 aa  241  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.9 
 
 		 740 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  33.24 
 
 		 709 aa  235  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.72 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.6 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.6 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.6 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.6 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.37 
 
 		 730 aa  230  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.27 
 
 		 730 aa  230  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.85 
 
 		 730 aa  230  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.58 
 
 		 737 aa  227  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.11 
 
 		 766 aa  226  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.62 
 
 		 741 aa  226  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  31.97 
 
 		 745 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.4 
 
 		 729 aa  225  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.63 
 
 		 979 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.36 
 
 		 983 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>