More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3665 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  53.38 
 
 		 731 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 735 aa  1421    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  52.67 
 
 		 728 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  70.83 
 
 		 724 aa  886    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  91.43 
 
 		 735 aa  1253    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  53.18 
 
 		 734 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  52.16 
 
 		 832 aa  628  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  52.95 
 
 		 755 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  50.88 
 
 		 737 aa  611  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  51.09 
 
 		 723 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  47.54 
 
 		 793 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  44.78 
 
 		 779 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  44.26 
 
 		 779 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  45.66 
 
 		 787 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  46.88 
 
 		 734 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  43.13 
 
 		 742 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  44.89 
 
 		 732 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  46.88 
 
 		 729 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  44.34 
 
 		 920 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  48.18 
 
 		 734 aa  502  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  42.53 
 
 		 772 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  42.53 
 
 		 772 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  45.15 
 
 		 917 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  42.53 
 
 		 772 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  43.14 
 
 		 909 aa  490  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  45.75 
 
 		 1002 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  49.51 
 
 		 843 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  43.13 
 
 		 791 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.69 
 
 		 1382 aa  475  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  50.65 
 
 		 840 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  36.78 
 
 		 829 aa  472  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  36.78 
 
 		 829 aa  472  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  49.05 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  45.95 
 
 		 1058 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.86 
 
 		 746 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  39.35 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  44.73 
 
 		 854 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  41.04 
 
 		 784 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  36.85 
 
 		 893 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  40.74 
 
 		 735 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  46.28 
 
 		 738 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  43.74 
 
 		 958 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  39.05 
 
 		 842 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  42.72 
 
 		 903 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  42.33 
 
 		 807 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  43.84 
 
 		 732 aa  425  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1092 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  41.36 
 
 		 787 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.49 
 
 		 732 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  43.71 
 
 		 903 aa  412  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33.93 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  39.48 
 
 		 752 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  40.27 
 
 		 876 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.94 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  37.84 
 
 		 758 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  42.05 
 
 		 737 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  45.99 
 
 		 726 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.74 
 
 		 735 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.9 
 
 		 723 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.5 
 
 		 717 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  35.72 
 
 		 760 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  36.26 
 
 		 740 aa  365  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  36.04 
 
 		 737 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.16 
 
 		 718 aa  363  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  38.9 
 
 		 751 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  38.97 
 
 		 714 aa  354  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  36.86 
 
 		 726 aa  350  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  35.59 
 
 		 749 aa  349  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  36.83 
 
 		 711 aa  346  8e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.25 
 
 		 796 aa  337  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.97 
 
 		 750 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  36.86 
 
 		 715 aa  331  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.94 
 
 		 743 aa  324  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  38.49 
 
 		 724 aa  324  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  36.47 
 
 		 761 aa  321  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  34.97 
 
 		 836 aa  309  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  34.68 
 
 		 781 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.88 
 
 		 968 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.93 
 
 		 978 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.87 
 
 		 983 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.87 
 
 		 983 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.87 
 
 		 979 aa  277  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.61 
 
 		 966 aa  273  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.5 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.87 
 
 		 738 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.34 
 
 		 758 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 710 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.46 
 
 		 766 aa  253  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  31.12 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.97 
 
 		 751 aa  239  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.03 
 
 		 730 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.28 
 
 		 846 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  30.56 
 
 		 751 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  31.37 
 
 		 731 aa  237  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.45 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.45 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.45 
 
 		 730 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.32 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.45 
 
 		 730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>