More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1612 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  51.71 
 
 		 738 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  52.31 
 
 		 748 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  51.25 
 
 		 767 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  53.54 
 
 		 769 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  100 
 
 		 770 aa  1524    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  52.45 
 
 		 736 aa  678    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  52.31 
 
 		 754 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  51.25 
 
 		 767 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  53.71 
 
 		 743 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  53.54 
 
 		 769 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  55.14 
 
 		 727 aa  685    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  50.79 
 
 		 1155 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  51.86 
 
 		 778 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  53.57 
 
 		 738 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  51.38 
 
 		 767 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  54.7 
 
 		 751 aa  739    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  50.14 
 
 		 731 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  43.88 
 
 		 796 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  42.66 
 
 		 741 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  42.88 
 
 		 773 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  40.92 
 
 		 783 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  43.38 
 
 		 724 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  42.03 
 
 		 839 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  39.25 
 
 		 766 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  41.63 
 
 		 733 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  40.19 
 
 		 953 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  37.15 
 
 		 740 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  52.89 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.77 
 
 		 740 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  37.07 
 
 		 710 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  39.37 
 
 		 717 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  36.34 
 
 		 738 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.02 
 
 		 1308 aa  376  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  36.01 
 
 		 805 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  38.1 
 
 		 762 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  35.79 
 
 		 758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.19 
 
 		 731 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  31.72 
 
 		 1013 aa  337  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.67 
 
 		 738 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.82 
 
 		 761 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.71 
 
 		 1095 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  30.55 
 
 		 944 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.67 
 
 		 730 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.43 
 
 		 730 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.43 
 
 		 730 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.43 
 
 		 730 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.43 
 
 		 730 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.71 
 
 		 730 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.61 
 
 		 730 aa  300  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.57 
 
 		 730 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  32.79 
 
 		 997 aa  295  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.13 
 
 		 730 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  36.66 
 
 		 743 aa  294  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.41 
 
 		 730 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  37.91 
 
 		 709 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.22 
 
 		 729 aa  275  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.47 
 
 		 757 aa  273  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.71 
 
 		 717 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.25 
 
 		 979 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.25 
 
 		 983 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.25 
 
 		 983 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.38 
 
 		 740 aa  265  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.57 
 
 		 723 aa  261  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.73 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.7 
 
 		 745 aa  254  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.32 
 
 		 829 aa  253  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.32 
 
 		 829 aa  253  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.18 
 
 		 704 aa  251  5e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  36.79 
 
 		 758 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.89 
 
 		 842 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.69 
 
 		 846 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.62 
 
 		 724 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  31.99 
 
 		 793 aa  244  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  31.85 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.22 
 
 		 741 aa  241  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.8 
 
 		 978 aa  241  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.94 
 
 		 966 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.15 
 
 		 737 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.99 
 
 		 735 aa  237  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.27 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  31.05 
 
 		 735 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.15 
 
 		 723 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.18 
 
 		 734 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.38 
 
 		 726 aa  234  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30 
 
 		 718 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.53 
 
 		 893 aa  233  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.94 
 
 		 731 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  31.59 
 
 		 832 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.47 
 
 		 968 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.29 
 
 		 752 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.73 
 
 		 714 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.7 
 
 		 755 aa  224  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.11 
 
 		 781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.47 
 
 		 735 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  43.75 
 
 		 361 aa  220  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  34.31 
 
 		 704 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  31.29 
 
 		 732 aa  218  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.35 
 
 		 737 aa  217  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  30.09 
 
 		 728 aa  216  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>