More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4060 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1494    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  67.49 
 
 		 796 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  48.01 
 
 		 741 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  44.33 
 
 		 724 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  41.28 
 
 		 770 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  44.26 
 
 		 748 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  41.57 
 
 		 769 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  44.26 
 
 		 754 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  41.57 
 
 		 769 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  42.02 
 
 		 751 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 1155 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  41.07 
 
 		 736 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  43.1 
 
 		 733 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  43.34 
 
 		 727 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  41.04 
 
 		 738 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  41.92 
 
 		 839 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  41.14 
 
 		 743 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  40.97 
 
 		 738 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.28 
 
 		 740 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  41.27 
 
 		 778 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  38.57 
 
 		 766 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  41.2 
 
 		 717 aa  422  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  39.02 
 
 		 767 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  39.02 
 
 		 767 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  38.92 
 
 		 767 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  39.74 
 
 		 731 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  37.16 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  36.06 
 
 		 740 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  35.72 
 
 		 758 aa  366  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  35.12 
 
 		 805 aa  360  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.51 
 
 		 1308 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  36.86 
 
 		 738 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.36 
 
 		 731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.92 
 
 		 741 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.6 
 
 		 1095 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.2 
 
 		 1013 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  35.65 
 
 		 743 aa  295  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.04 
 
 		 738 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  40.91 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  30.33 
 
 		 944 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.42 
 
 		 997 aa  281  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  26.95 
 
 		 730 aa  276  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.92 
 
 		 730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.79 
 
 		 730 aa  273  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.92 
 
 		 730 aa  273  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.92 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.53 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.92 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.82 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.92 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.18 
 
 		 730 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  34.77 
 
 		 757 aa  267  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.67 
 
 		 761 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  35.19 
 
 		 709 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.79 
 
 		 740 aa  253  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  51.62 
 
 		 773 aa  253  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27 
 
 		 729 aa  251  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.23 
 
 		 752 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.15 
 
 		 735 aa  240  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.47 
 
 		 745 aa  238  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.4 
 
 		 723 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.38 
 
 		 737 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.27 
 
 		 842 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.84 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.43 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.01 
 
 		 758 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.2 
 
 		 717 aa  217  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 		 761 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.63 
 
 		 760 aa  212  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.44 
 
 		 983 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.44 
 
 		 983 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.53 
 
 		 979 aa  208  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.05 
 
 		 718 aa  207  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  28.45 
 
 		 978 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.02 
 
 		 724 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.78 
 
 		 731 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 		 735 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 734 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  31 
 
 		 751 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.73 
 
 		 741 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  31.16 
 
 		 735 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  41.83 
 
 		 953 aa  194  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30 
 
 		 740 aa  193  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  31.05 
 
 		 751 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.79 
 
 		 781 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  37.96 
 
 		 814 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.77 
 
 		 749 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  30.6 
 
 		 714 aa  191  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.31 
 
 		 968 aa  191  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.99 
 
 		 726 aa  190  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.38 
 
 		 736 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.19 
 
 		 966 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.37 
 
 		 704 aa  187  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  29.73 
 
 		 779 aa  187  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  27.66 
 
 		 734 aa  187  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  30.63 
 
 		 743 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.03 
 
 		 729 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  24.14 
 
 		 829 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  29.03 
 
 		 794 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  24.14 
 
 		 829 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>