More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2752 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  54.26 
 
 		 740 aa  688    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  100 
 
 		 724 aa  1383    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  44.72 
 
 		 796 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  43.15 
 
 		 741 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  41.76 
 
 		 751 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  40.9 
 
 		 769 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  40.9 
 
 		 769 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  42.12 
 
 		 738 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  43.25 
 
 		 770 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 1155 aa  465  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  44.15 
 
 		 783 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  42.62 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  40.79 
 
 		 748 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  40.79 
 
 		 754 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  40.55 
 
 		 778 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  41.96 
 
 		 953 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  41.46 
 
 		 839 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  40.8 
 
 		 767 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  40.8 
 
 		 767 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  40.67 
 
 		 767 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  40.43 
 
 		 736 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  40.67 
 
 		 727 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 766 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  38.61 
 
 		 733 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  40.44 
 
 		 738 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  41.96 
 
 		 731 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  41.31 
 
 		 717 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  37.71 
 
 		 738 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  34.38 
 
 		 740 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  38.74 
 
 		 731 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  35.79 
 
 		 710 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.17 
 
 		 1308 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.44 
 
 		 805 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  38.15 
 
 		 762 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.05 
 
 		 758 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  47.75 
 
 		 773 aa  318  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  35.31 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.17 
 
 		 738 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  36.25 
 
 		 743 aa  303  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.66 
 
 		 761 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  30.48 
 
 		 1013 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.35 
 
 		 1095 aa  287  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  31.12 
 
 		 944 aa  279  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  38.33 
 
 		 500 aa  279  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.08 
 
 		 709 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.56 
 
 		 757 aa  273  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.53 
 
 		 997 aa  267  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.74 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.74 
 
 		 846 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  32.96 
 
 		 745 aa  256  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.39 
 
 		 730 aa  250  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.06 
 
 		 740 aa  250  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.99 
 
 		 737 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.26 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.26 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.26 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.33 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.13 
 
 		 730 aa  248  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.74 
 
 		 730 aa  246  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  32.37 
 
 		 744 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  26.12 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.12 
 
 		 842 aa  239  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  26.01 
 
 		 730 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  25.94 
 
 		 730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.23 
 
 		 752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.03 
 
 		 743 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 726 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  33.11 
 
 		 714 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.23 
 
 		 758 aa  231  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.4 
 
 		 735 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  32.93 
 
 		 751 aa  227  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.83 
 
 		 717 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.56 
 
 		 781 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.78 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.58 
 
 		 704 aa  223  9e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.88 
 
 		 979 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.88 
 
 		 983 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.88 
 
 		 983 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.29 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.85 
 
 		 724 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.17 
 
 		 760 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.61 
 
 		 758 aa  220  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.26 
 
 		 743 aa  220  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  35.21 
 
 		 732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.34 
 
 		 718 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  32.64 
 
 		 761 aa  216  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  35.42 
 
 		 723 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.09 
 
 		 978 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  30.68 
 
 		 745 aa  214  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.34 
 
 		 736 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.2 
 
 		 832 aa  214  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.56 
 
 		 723 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.85 
 
 		 796 aa  211  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.57 
 
 		 749 aa  210  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.52 
 
 		 740 aa  208  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  31.4 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.33 
 
 		 968 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.69 
 
 		 711 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.57 
 
 		 735 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>