More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0364 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  100 
 
 		 997 aa  1993    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  43.05 
 
 		 1013 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.55 
 
 		 1095 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  43.83 
 
 		 944 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  48.19 
 
 		 1110 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  35.44 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  43.95 
 
 		 1093 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  43.95 
 
 		 1093 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  43.77 
 
 		 1089 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  36.06 
 
 		 632 aa  348  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  31.11 
 
 		 740 aa  347  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.89 
 
 		 766 aa  318  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.93 
 
 		 733 aa  313  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.5 
 
 		 1308 aa  304  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  30.12 
 
 		 738 aa  301  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  29.81 
 
 		 805 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  31.54 
 
 		 796 aa  290  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.46 
 
 		 731 aa  287  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.05 
 
 		 717 aa  281  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  32.35 
 
 		 727 aa  281  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  33.39 
 
 		 741 aa  280  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  32.84 
 
 		 770 aa  278  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  32.31 
 
 		 762 aa  270  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 1155 aa  265  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  30.89 
 
 		 736 aa  263  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  31.01 
 
 		 751 aa  262  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  28.88 
 
 		 754 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  29.82 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  28.88 
 
 		 748 aa  261  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.73 
 
 		 730 aa  260  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  31.43 
 
 		 738 aa  260  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.76 
 
 		 730 aa  259  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  30.28 
 
 		 769 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  30.28 
 
 		 769 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.45 
 
 		 730 aa  258  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.48 
 
 		 730 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.26 
 
 		 730 aa  254  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.96 
 
 		 758 aa  254  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  30.53 
 
 		 783 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  26.88 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  26.88 
 
 		 730 aa  253  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  26.88 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  26.88 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.98 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.06 
 
 		 730 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.85 
 
 		 740 aa  244  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.07 
 
 		 729 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  30.24 
 
 		 757 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  31.55 
 
 		 773 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.81 
 
 		 717 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  31.19 
 
 		 738 aa  235  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  29.3 
 
 		 761 aa  234  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.74 
 
 		 738 aa  234  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  31.2 
 
 		 743 aa  231  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  29.36 
 
 		 767 aa  230  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  29.36 
 
 		 767 aa  230  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  29.36 
 
 		 767 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  30.43 
 
 		 778 aa  227  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.5 
 
 		 979 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.06 
 
 		 983 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.06 
 
 		 983 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.69 
 
 		 741 aa  221  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5546  RND superfamily drug efflux protein  58.14 
 
 		 243 aa  220  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0356302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  30.77 
 
 		 731 aa  219  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  29.9 
 
 		 839 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  26.96 
 
 		 779 aa  217  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.25 
 
 		 743 aa  217  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  28.19 
 
 		 736 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  28.03 
 
 		 758 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  27.8 
 
 		 846 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.48 
 
 		 743 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.04 
 
 		 718 aa  204  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  30.35 
 
 		 724 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  27.34 
 
 		 760 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.64 
 
 		 737 aa  202  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.78 
 
 		 749 aa  201  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  30 
 
 		 745 aa  201  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.12 
 
 		 737 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  30.76 
 
 		 709 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.11 
 
 		 1382 aa  197  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.35 
 
 		 737 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.09 
 
 		 743 aa  195  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  29.83 
 
 		 893 aa  193  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  30.22 
 
 		 794 aa  194  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  27.69 
 
 		 842 aa  194  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  26.03 
 
 		 735 aa  192  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  28.18 
 
 		 752 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.03 
 
 		 740 aa  191  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  27.45 
 
 		 978 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.58 
 
 		 758 aa  191  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.49 
 
 		 734 aa  190  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  27.88 
 
 		 740 aa  190  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  26.56 
 
 		 966 aa  190  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  27.79 
 
 		 735 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  27.86 
 
 		 761 aa  189  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  29.52 
 
 		 741 aa  187  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  27.41 
 
 		 968 aa  187  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  27.65 
 
 		 832 aa  185  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.41 
 
 		 829 aa  185  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.41 
 
 		 829 aa  185  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>