More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5544 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  65.88 
 
 		 944 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  100 
 
 		 632 aa  1272    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  61.76 
 
 		 1013 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  49.02 
 
 		 1095 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  60.52 
 
 		 1089 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  59.94 
 
 		 1110 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  60.23 
 
 		 1093 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  60.23 
 
 		 1093 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  36.06 
 
 		 997 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.74 
 
 		 710 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.52 
 
 		 733 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.41 
 
 		 766 aa  258  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  33.16 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.88 
 
 		 805 aa  229  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  31.88 
 
 		 731 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  29.8 
 
 		 740 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  32.66 
 
 		 738 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.26 
 
 		 1155 aa  211  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  31.89 
 
 		 743 aa  203  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  30.22 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  27.68 
 
 		 770 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.65 
 
 		 1308 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  28.43 
 
 		 741 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  29.09 
 
 		 738 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  29.84 
 
 		 751 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  29.84 
 
 		 769 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  29.84 
 
 		 769 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  30.26 
 
 		 762 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  28.33 
 
 		 767 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  28.33 
 
 		 767 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.48 
 
 		 796 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  28.36 
 
 		 736 aa  177  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.61 
 
 		 758 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  28.16 
 
 		 767 aa  173  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.45 
 
 		 724 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  26.81 
 
 		 738 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  28.62 
 
 		 731 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  24.87 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  26.25 
 
 		 748 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  26.25 
 
 		 754 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  27.88 
 
 		 783 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  32.57 
 
 		 773 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  28.33 
 
 		 953 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  27.2 
 
 		 778 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  26.65 
 
 		 735 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  27.63 
 
 		 983 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  27.63 
 
 		 983 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  24.16 
 
 		 814 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  27.41 
 
 		 979 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  29.05 
 
 		 745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  24.87 
 
 		 740 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.35 
 
 		 737 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  27.86 
 
 		 839 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  27.87 
 
 		 761 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.14 
 
 		 717 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  25.83 
 
 		 743 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  26.68 
 
 		 750 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  29.04 
 
 		 757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  26.41 
 
 		 740 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.45 
 
 		 736 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  27.07 
 
 		 793 aa  114  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  25.65 
 
 		 737 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31 
 
 		 738 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  27.07 
 
 		 734 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.16 
 
 		 743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.11 
 
 		 749 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  21.44 
 
 		 730 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  25.13 
 
 		 737 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  30.28 
 
 		 743 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  34.66 
 
 		 847 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  29.06 
 
 		 361 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  25 
 
 		 779 aa  108  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  21.22 
 
 		 730 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  21.22 
 
 		 730 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  21.22 
 
 		 730 aa  107  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  26.17 
 
 		 741 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  20.03 
 
 		 730 aa  107  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  20.19 
 
 		 730 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.16 
 
 		 796 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  22.66 
 
 		 968 aa  104  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  28.65 
 
 		 776 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  25.57 
 
 		 846 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  22.05 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  22.09 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.61 
 
 		 740 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  28.82 
 
 		 723 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  24.74 
 
 		 752 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  29.64 
 
 		 841 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1710  MMPL domain protein  28.4 
 
 		 1050 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  21.43 
 
 		 729 aa  101  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  25.59 
 
 		 718 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  20.22 
 
 		 730 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  24.44 
 
 		 718 aa  99.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 		 755 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  26.17 
 
 		 726 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  22.18 
 
 		 730 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  26.42 
 
 		 743 aa  97.8  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  23.85 
 
 		 966 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  24.47 
 
 		 978 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  26.23 
 
 		 709 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>