More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1537 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  100 
 
 		 839 aa  1640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  61.25 
 
 		 953 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  42.03 
 
 		 770 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.52 
 
 		 724 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  39.19 
 
 		 741 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  41.7 
 
 		 738 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  40.24 
 
 		 1155 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  40.7 
 
 		 796 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  38.62 
 
 		 751 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  37.73 
 
 		 769 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  37.73 
 
 		 769 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.44 
 
 		 740 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  41.32 
 
 		 783 aa  438  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  40.38 
 
 		 727 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  40.85 
 
 		 733 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  37.3 
 
 		 738 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  39.85 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  39.37 
 
 		 748 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  39.37 
 
 		 754 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  38.38 
 
 		 778 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 743 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  38.56 
 
 		 767 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.15 
 
 		 766 aa  406  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  38.56 
 
 		 767 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  38.22 
 
 		 767 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  37.98 
 
 		 717 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 731 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  37.57 
 
 		 738 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.48 
 
 		 1308 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  38.34 
 
 		 731 aa  362  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.82 
 
 		 740 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  33.85 
 
 		 710 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  34.86 
 
 		 758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.63 
 
 		 805 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.29 
 
 		 741 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  37.97 
 
 		 762 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34 
 
 		 738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.84 
 
 		 730 aa  300  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34 
 
 		 743 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.67 
 
 		 730 aa  297  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.55 
 
 		 730 aa  298  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.51 
 
 		 730 aa  298  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.55 
 
 		 730 aa  298  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.55 
 
 		 730 aa  298  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  29.05 
 
 		 730 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.19 
 
 		 729 aa  296  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.81 
 
 		 730 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.89 
 
 		 730 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.98 
 
 		 761 aa  291  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.3 
 
 		 730 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  38.97 
 
 		 500 aa  273  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.66 
 
 		 1013 aa  272  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.99 
 
 		 1095 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.94 
 
 		 757 aa  263  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.06 
 
 		 944 aa  261  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.19 
 
 		 745 aa  261  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  29.81 
 
 		 997 aa  257  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  34.82 
 
 		 709 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.15 
 
 		 741 aa  237  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.54 
 
 		 740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.03 
 
 		 717 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  29.83 
 
 		 979 aa  232  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  26.62 
 
 		 829 aa  231  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  26.62 
 
 		 829 aa  231  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  31.43 
 
 		 983 aa  230  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  31.43 
 
 		 983 aa  230  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.38 
 
 		 842 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.99 
 
 		 724 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.19 
 
 		 743 aa  223  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.48 
 
 		 743 aa  221  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.42 
 
 		 781 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.89 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.05 
 
 		 750 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31 
 
 		 737 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.63 
 
 		 737 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  31.41 
 
 		 744 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  46.23 
 
 		 773 aa  211  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.47 
 
 		 893 aa  210  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.82 
 
 		 704 aa  209  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.61 
 
 		 978 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  28.83 
 
 		 735 aa  208  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  30.01 
 
 		 735 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  30.12 
 
 		 751 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  28.75 
 
 		 966 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  28.85 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  29.92 
 
 		 761 aa  204  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 737 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  28.65 
 
 		 752 aa  200  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.05 
 
 		 735 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  30.48 
 
 		 734 aa  198  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  29.88 
 
 		 740 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  28.84 
 
 		 732 aa  197  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  27.08 
 
 		 749 aa  195  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.24 
 
 		 726 aa  194  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.01 
 
 		 723 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  30.17 
 
 		 734 aa  194  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  31.12 
 
 		 732 aa  193  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  30.07 
 
 		 793 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  29.29 
 
 		 832 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  30.6 
 
 		 714 aa  190  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>