More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 762 aa  1418    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  47.53 
 
 		 731 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  47.26 
 
 		 738 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  44.16 
 
 		 733 aa  512  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  45.42 
 
 		 717 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  39.9 
 
 		 740 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  43.03 
 
 		 766 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.98 
 
 		 1308 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  39.19 
 
 		 805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  41.06 
 
 		 710 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  38.42 
 
 		 770 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  35.9 
 
 		 758 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  36.58 
 
 		 741 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  39.57 
 
 		 796 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  37.77 
 
 		 1155 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  36.64 
 
 		 751 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  34.03 
 
 		 1013 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  38.51 
 
 		 727 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.29 
 
 		 724 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  35.89 
 
 		 769 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  35.89 
 
 		 769 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  36.84 
 
 		 743 aa  361  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  36.43 
 
 		 736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  36.92 
 
 		 738 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  36.73 
 
 		 738 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  38.49 
 
 		 839 aa  356  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  34.26 
 
 		 741 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  35.26 
 
 		 944 aa  351  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  37.17 
 
 		 783 aa  350  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.19 
 
 		 1095 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  40.08 
 
 		 743 aa  343  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  35.54 
 
 		 748 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  35.4 
 
 		 754 aa  341  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.1 
 
 		 740 aa  331  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  36.66 
 
 		 761 aa  331  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  35.29 
 
 		 778 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  33.25 
 
 		 997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  36.85 
 
 		 767 aa  326  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  36.85 
 
 		 767 aa  326  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.02 
 
 		 738 aa  326  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  36.72 
 
 		 767 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  36.05 
 
 		 731 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  36.9 
 
 		 953 aa  318  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  38.1 
 
 		 757 aa  295  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  38.94 
 
 		 709 aa  289  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.7 
 
 		 730 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.5 
 
 		 730 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.83 
 
 		 730 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.83 
 
 		 730 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.83 
 
 		 730 aa  278  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.48 
 
 		 730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.86 
 
 		 730 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.32 
 
 		 729 aa  273  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.37 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.06 
 
 		 730 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.93 
 
 		 730 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  35.04 
 
 		 737 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.78 
 
 		 740 aa  266  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.46 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.47 
 
 		 846 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.05 
 
 		 717 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  39.23 
 
 		 745 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.95 
 
 		 743 aa  250  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 736 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.97 
 
 		 734 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.52 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  32.93 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  33.28 
 
 		 920 aa  239  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.68 
 
 		 704 aa  238  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  34.87 
 
 		 734 aa  235  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.5 
 
 		 740 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  41.84 
 
 		 773 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.45 
 
 		 979 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.45 
 
 		 983 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.45 
 
 		 983 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  36.19 
 
 		 741 aa  233  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.78 
 
 		 723 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  33.75 
 
 		 842 aa  230  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.92 
 
 		 731 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  34.1 
 
 		 917 aa  227  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.36 
 
 		 724 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  31.64 
 
 		 737 aa  225  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  31.88 
 
 		 745 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  30.63 
 
 		 779 aa  223  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  32.62 
 
 		 735 aa  223  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.71 
 
 		 726 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.56 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.04 
 
 		 732 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.34 
 
 		 829 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.34 
 
 		 829 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  32.25 
 
 		 978 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  31.52 
 
 		 735 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  31.32 
 
 		 744 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.19 
 
 		 966 aa  213  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.56 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.6 
 
 		 750 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.33 
 
 		 752 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  33.15 
 
 		 968 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  31.76 
 
 		 728 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.95 
 
 		 723 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>