More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3388 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
846 aa  1664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  57.6 
 
 
743 aa  753    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  51.88 
 
 
743 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0201  MMPL domain-containing protein  49.27 
 
 
847 aa  594  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202798  normal  0.837468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  49.17 
 
 
744 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  46.1 
 
 
745 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  44.52 
 
 
736 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  40.53 
 
 
737 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  38.49 
 
 
794 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1952  MMPL domain-containing protein  38.87 
 
 
729 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0752797  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  37.47 
 
 
758 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.02 
 
 
743 aa  324  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.59 
 
 
758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.53 
 
 
740 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.31 
 
 
842 aa  298  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  34.65 
 
 
979 aa  297  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  34.76 
 
 
983 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  34.76 
 
 
983 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.43 
 
 
738 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.47 
 
 
717 aa  290  9e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.05 
 
 
805 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  33.16 
 
 
737 aa  290  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.73 
 
 
978 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  34.27 
 
 
968 aa  285  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.88 
 
 
966 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.29 
 
 
1308 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.02 
 
 
743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.54 
 
 
741 aa  273  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  34.56 
 
 
738 aa  273  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.58 
 
 
766 aa  273  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.24 
 
 
729 aa  271  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  33.2 
 
 
733 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.4 
 
 
735 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.06 
 
 
724 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  31.93 
 
 
761 aa  268  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.29 
 
 
737 aa  267  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.63 
 
 
1155 aa  266  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.52 
 
 
718 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.61 
 
 
752 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  32.86 
 
 
748 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 
754 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  32.02 
 
 
728 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  31.48 
 
 
876 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 
832 aa  260  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.97 
 
 
723 aa  260  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.47 
 
 
732 aa  260  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  31.69 
 
 
770 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.74 
 
 
730 aa  259  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  34.7 
 
 
743 aa  259  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.91 
 
 
731 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.6 
 
 
730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.33 
 
 
734 aa  254  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.84 
 
 
735 aa  254  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  37.07 
 
 
723 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.27 
 
 
730 aa  251  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.86 
 
 
730 aa  250  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.72 
 
 
730 aa  250  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.86 
 
 
730 aa  250  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.86 
 
 
730 aa  250  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.86 
 
 
730 aa  250  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.75 
 
 
730 aa  250  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.7 
 
 
743 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.79 
 
 
781 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.9 
 
 
758 aa  249  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  31.99 
 
 
1002 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.08 
 
 
730 aa  248  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  37.24 
 
 
761 aa  248  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.85 
 
 
740 aa  248  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  29.73 
 
 
760 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.73 
 
 
1095 aa  245  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  32.15 
 
 
717 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.99 
 
 
704 aa  243  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  30.68 
 
 
737 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  32.94 
 
 
731 aa  243  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  33.46 
 
 
767 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  33.46 
 
 
767 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.73 
 
 
944 aa  242  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  33.38 
 
 
715 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  32.59 
 
 
738 aa  241  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  31.79 
 
 
741 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  26.82 
 
 
729 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  31.87 
 
 
736 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  32.56 
 
 
755 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  33.59 
 
 
767 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  33.62 
 
 
727 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  31.79 
 
 
751 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.14 
 
 
746 aa  238  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.18 
 
 
745 aa  238  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.54 
 
 
711 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.93 
 
 
740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.69 
 
 
796 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  28.4 
 
 
749 aa  236  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  32.2 
 
 
738 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  32.11 
 
 
735 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  31.26 
 
 
769 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.8 
 
 
997 aa  234  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  31.26 
 
 
769 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  33.33 
 
 
762 aa  234  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  30.03 
 
 
750 aa  232  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.06 
 
 
1013 aa  231  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>