More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4573 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  51.86 
 
 		 770 aa  724    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  68.01 
 
 		 748 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  63.84 
 
 		 767 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  74.81 
 
 		 769 aa  1083    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  72.07 
 
 		 500 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  52.72 
 
 		 736 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  68.01 
 
 		 754 aa  908    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  63.84 
 
 		 767 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  66.4 
 
 		 743 aa  924    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  74.81 
 
 		 769 aa  1083    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  67.3 
 
 		 727 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  62.32 
 
 		 1155 aa  919    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 778 aa  1528    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  63.58 
 
 		 767 aa  854    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  74.22 
 
 		 751 aa  1069    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  49.15 
 
 		 738 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  56.6 
 
 		 731 aa  736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  82.03 
 
 		 738 aa  1171    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  44.99 
 
 		 796 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  41.62 
 
 		 741 aa  469  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.05 
 
 		 724 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  41.2 
 
 		 773 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  41.39 
 
 		 783 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  39.27 
 
 		 839 aa  429  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  37.78 
 
 		 733 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.08 
 
 		 740 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  39.12 
 
 		 953 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  36.89 
 
 		 766 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.79 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  34.31 
 
 		 740 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  34.57 
 
 		 710 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.38 
 
 		 1308 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  62.37 
 
 		 361 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  36.33 
 
 		 731 aa  347  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 758 aa  346  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  34.43 
 
 		 805 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.06 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.8 
 
 		 1013 aa  323  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  33.86 
 
 		 738 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.57 
 
 		 1095 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  35.24 
 
 		 762 aa  314  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  30.88 
 
 		 944 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.82 
 
 		 738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  35.1 
 
 		 761 aa  301  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  26.97 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.24 
 
 		 730 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.24 
 
 		 730 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.24 
 
 		 730 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.24 
 
 		 730 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.3 
 
 		 730 aa  283  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27 
 
 		 730 aa  283  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  26.7 
 
 		 730 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  27.46 
 
 		 997 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  26.73 
 
 		 730 aa  279  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  32.42 
 
 		 743 aa  275  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.84 
 
 		 729 aa  270  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.2 
 
 		 757 aa  263  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.22 
 
 		 717 aa  258  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  33.03 
 
 		 709 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.89 
 
 		 740 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.61 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.42 
 
 		 723 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.14 
 
 		 735 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  30.41 
 
 		 842 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 846 aa  234  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  28.1 
 
 		 781 aa  228  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.52 
 
 		 752 aa  227  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  30.99 
 
 		 758 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.59 
 
 		 832 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  30.61 
 
 		 723 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.31 
 
 		 726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 724 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  28.99 
 
 		 758 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.05 
 
 		 979 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.05 
 
 		 983 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.05 
 
 		 983 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  25.98 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  28.95 
 
 		 735 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.27 
 
 		 734 aa  214  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.89 
 
 		 718 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 741 aa  212  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.16 
 
 		 737 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  29.13 
 
 		 735 aa  210  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.58 
 
 		 829 aa  210  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.58 
 
 		 829 aa  210  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.76 
 
 		 978 aa  210  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.12 
 
 		 743 aa  210  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  29.95 
 
 		 731 aa  207  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  30.51 
 
 		 737 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  29.18 
 
 		 718 aa  207  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  30.29 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.18 
 
 		 714 aa  206  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  27.39 
 
 		 743 aa  203  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.04 
 
 		 893 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.19 
 
 		 761 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.78 
 
 		 968 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.33 
 
 		 728 aa  201  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  29.44 
 
 		 755 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.92 
 
 		 796 aa  193  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>