More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0113 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  60.89 
 
 		 718 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  61.41 
 
 		 717 aa  789    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  62.96 
 
 		 726 aa  780    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  100 
 
 		 724 aa  1389    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  42.94 
 
 		 735 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  46.34 
 
 		 752 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  44.01 
 
 		 758 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  44.43 
 
 		 842 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  44.88 
 
 		 737 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  40.49 
 
 		 760 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.4 
 
 		 743 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  39.94 
 
 		 781 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  55.41 
 
 		 841 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  38.32 
 
 		 749 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 829 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.76 
 
 		 729 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 829 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  43.03 
 
 		 731 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  41.36 
 
 		 832 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  41.23 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  42.55 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.38 
 
 		 735 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  42.98 
 
 		 755 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  39.92 
 
 		 734 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  37.16 
 
 		 740 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  42.27 
 
 		 714 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.4 
 
 		 742 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.26 
 
 		 734 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  39.21 
 
 		 728 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  40.91 
 
 		 715 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  37.98 
 
 		 750 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.26 
 
 		 793 aa  369  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.93 
 
 		 761 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  41.03 
 
 		 732 aa  365  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  38.44 
 
 		 735 aa  357  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  37.78 
 
 		 732 aa  356  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  35.08 
 
 		 920 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.44 
 
 		 876 aa  355  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  40.47 
 
 		 711 aa  349  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  37.88 
 
 		 735 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  38 
 
 		 737 aa  348  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.49 
 
 		 796 aa  346  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  33 
 
 		 704 aa  345  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  30.22 
 
 		 893 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 734 aa  343  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.9 
 
 		 1382 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  36.78 
 
 		 917 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  41.24 
 
 		 751 aa  342  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  34.91 
 
 		 779 aa  342  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.51 
 
 		 743 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  37.33 
 
 		 787 aa  339  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  39.94 
 
 		 724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  35.15 
 
 		 772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  35.15 
 
 		 772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  35.15 
 
 		 772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  36.43 
 
 		 807 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.73 
 
 		 730 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.59 
 
 		 730 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.59 
 
 		 730 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.59 
 
 		 730 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.59 
 
 		 730 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  34.04 
 
 		 909 aa  313  7.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  29.76 
 
 		 730 aa  313  9e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  30.52 
 
 		 730 aa  309  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  30.09 
 
 		 730 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  31.81 
 
 		 758 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.09 
 
 		 730 aa  308  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  36.66 
 
 		 729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  37.06 
 
 		 734 aa  305  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 779 aa  305  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  36.23 
 
 		 1002 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  37.41 
 
 		 1058 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.47 
 
 		 746 aa  296  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  38.97 
 
 		 726 aa  296  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  34.76 
 
 		 903 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  33.05 
 
 		 710 aa  294  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 741 aa  293  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  38.39 
 
 		 854 aa  290  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.53 
 
 		 730 aa  290  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  34.83 
 
 		 787 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  34.14 
 
 		 770 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.88 
 
 		 738 aa  282  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.39 
 
 		 740 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  36.07 
 
 		 983 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  36.07 
 
 		 983 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  37.52 
 
 		 843 aa  276  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  34.94 
 
 		 766 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.53 
 
 		 979 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.46 
 
 		 729 aa  273  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.12 
 
 		 1308 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  50 
 
 		 776 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  36.28 
 
 		 903 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  33.66 
 
 		 727 aa  271  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  34.09 
 
 		 958 aa  270  8.999999999999999e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  35.88 
 
 		 737 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  36.24 
 
 		 732 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  33.01 
 
 		 745 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.79 
 
 		 743 aa  268  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  32.92 
 
 		 796 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.14 
 
 		 978 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>