More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 920 aa  1785    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  49.57 
 
 		 909 aa  703    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  47.02 
 
 		 917 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  48.17 
 
 		 1002 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  49.26 
 
 		 903 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  45.01 
 
 		 731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  45.01 
 
 		 832 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  46.92 
 
 		 903 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  45.65 
 
 		 734 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  43.33 
 
 		 728 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  43.22 
 
 		 723 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  44.13 
 
 		 755 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  44.8 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  44.08 
 
 		 735 aa  475  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  44.34 
 
 		 735 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  41.76 
 
 		 737 aa  469  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  39.04 
 
 		 772 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 772 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  39.04 
 
 		 772 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  39.43 
 
 		 779 aa  459  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  42.54 
 
 		 787 aa  452  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.13 
 
 		 793 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  43.21 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  38.4 
 
 		 779 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  42.17 
 
 		 729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.47 
 
 		 829 aa  446  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.47 
 
 		 829 aa  446  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.51 
 
 		 734 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  37.52 
 
 		 732 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  34.71 
 
 		 893 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  37.69 
 
 		 743 aa  425  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  39.31 
 
 		 791 aa  422  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  42.25 
 
 		 958 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.52 
 
 		 842 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.65 
 
 		 1382 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.82 
 
 		 742 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  38.4 
 
 		 784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.6 
 
 		 746 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  42.55 
 
 		 843 aa  405  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  41.47 
 
 		 854 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  36.98 
 
 		 876 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  39.57 
 
 		 1058 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  45.19 
 
 		 840 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  35.7 
 
 		 735 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  38.92 
 
 		 787 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  42.98 
 
 		 1092 aa  389  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  35.56 
 
 		 717 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  42.37 
 
 		 726 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  35.09 
 
 		 760 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.85 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  39.26 
 
 		 807 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.61 
 
 		 704 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.87 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.19 
 
 		 735 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.01 
 
 		 729 aa  369  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  35.05 
 
 		 749 aa  369  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.66 
 
 		 737 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.93 
 
 		 732 aa  360  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.17 
 
 		 718 aa  360  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.11 
 
 		 715 aa  354  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  40.41 
 
 		 738 aa  347  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  39.3 
 
 		 737 aa  347  8e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.12 
 
 		 758 aa  342  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.85 
 
 		 723 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  38.44 
 
 		 732 aa  333  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.35 
 
 		 714 aa  330  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.91 
 
 		 711 aa  325  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.72 
 
 		 726 aa  324  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.11 
 
 		 781 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  41.4 
 
 		 726 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.94 
 
 		 761 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  34.83 
 
 		 724 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  32.89 
 
 		 740 aa  302  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.3 
 
 		 750 aa  300  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.08 
 
 		 743 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.7 
 
 		 979 aa  258  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.56 
 
 		 983 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.56 
 
 		 983 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  31.17 
 
 		 836 aa  248  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.67 
 
 		 743 aa  243  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.36 
 
 		 758 aa  240  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.15 
 
 		 966 aa  239  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  31.11 
 
 		 733 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  32.77 
 
 		 734 aa  238  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  28.4 
 
 		 978 aa  235  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.64 
 
 		 717 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.49 
 
 		 968 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.11 
 
 		 741 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.79 
 
 		 741 aa  224  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.41 
 
 		 737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  24.67 
 
 		 730 aa  220  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  24.67 
 
 		 730 aa  220  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  24.67 
 
 		 730 aa  220  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  24.54 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  24.54 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  35.93 
 
 		 841 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  24.65 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.27 
 
 		 740 aa  217  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  24.59 
 
 		 730 aa  217  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  24.56 
 
 		 730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>