More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3645 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 711 aa  1376    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  43.53 
 
 		 732 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  42.78 
 
 		 876 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  42.36 
 
 		 751 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  42.9 
 
 		 715 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  36.95 
 
 		 743 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  38.65 
 
 		 734 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  37.96 
 
 		 728 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  39.53 
 
 		 723 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  41.27 
 
 		 731 aa  382  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.35 
 
 		 842 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  39.94 
 
 		 755 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 829 aa  362  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  33.43 
 
 		 829 aa  362  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 832 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  39.46 
 
 		 723 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  38.98 
 
 		 761 aa  350  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  37.62 
 
 		 793 aa  349  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  38.79 
 
 		 737 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  31.28 
 
 		 893 aa  347  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  37.77 
 
 		 717 aa  346  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  36.89 
 
 		 917 aa  343  5e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  37.34 
 
 		 735 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.94 
 
 		 734 aa  342  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  36.69 
 
 		 735 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  40.75 
 
 		 714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  37.02 
 
 		 718 aa  336  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.73 
 
 		 729 aa  333  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  34.25 
 
 		 909 aa  331  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  35.79 
 
 		 732 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.77 
 
 		 779 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  37.45 
 
 		 752 aa  327  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  33.64 
 
 		 920 aa  327  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.89 
 
 		 735 aa  326  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  32.54 
 
 		 704 aa  324  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.97 
 
 		 740 aa  324  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  35.18 
 
 		 787 aa  323  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.13 
 
 		 735 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  37.17 
 
 		 750 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.22 
 
 		 743 aa  316  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.59 
 
 		 737 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  38.72 
 
 		 724 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.08 
 
 		 726 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  40.15 
 
 		 724 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  37.1 
 
 		 1002 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.21 
 
 		 758 aa  301  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.67 
 
 		 772 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 772 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.51 
 
 		 746 aa  295  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 772 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  36.04 
 
 		 734 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.78 
 
 		 742 aa  294  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.3 
 
 		 854 aa  293  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  33.25 
 
 		 791 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  35.85 
 
 		 779 aa  289  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  34.65 
 
 		 729 aa  285  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 749 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  37.14 
 
 		 781 aa  280  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  32.99 
 
 		 979 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  31.35 
 
 		 760 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.93 
 
 		 1382 aa  278  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.04 
 
 		 983 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.04 
 
 		 983 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  35.2 
 
 		 840 aa  273  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.7 
 
 		 740 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  35.33 
 
 		 1058 aa  272  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  35.55 
 
 		 1092 aa  270  7e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  33.69 
 
 		 807 aa  269  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33 
 
 		 741 aa  269  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  36.71 
 
 		 843 aa  267  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  32.93 
 
 		 737 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.39 
 
 		 726 aa  264  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  35.25 
 
 		 903 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 758 aa  263  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  30.35 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  30.43 
 
 		 730 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  35.26 
 
 		 732 aa  259  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  29.82 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.95 
 
 		 978 aa  259  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  29.82 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  29.82 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.89 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  29.82 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  29.82 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  36.68 
 
 		 738 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  36.13 
 
 		 903 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.78 
 
 		 734 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  36.1 
 
 		 968 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  38.58 
 
 		 736 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.53 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  36.6 
 
 		 966 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  35.54 
 
 		 846 aa  242  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.1 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  36.82 
 
 		 787 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  33.23 
 
 		 958 aa  239  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  30.78 
 
 		 784 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  34.59 
 
 		 733 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  31.59 
 
 		 738 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 		 796 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>