More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1977 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1462    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  68.56 
 
 		 740 aa  957    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  40.32 
 
 		 743 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  41.18 
 
 		 761 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  40.05 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.87 
 
 		 842 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  39.66 
 
 		 743 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  40.22 
 
 		 723 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.91 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.69 
 
 		 796 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  34.7 
 
 		 735 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  38.29 
 
 		 731 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.61 
 
 		 752 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.41 
 
 		 729 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  38.1 
 
 		 723 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  38.69 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  36.03 
 
 		 728 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  36.71 
 
 		 734 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.42 
 
 		 735 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  36.96 
 
 		 755 aa  366  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.51 
 
 		 876 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  39.5 
 
 		 751 aa  362  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  35.93 
 
 		 735 aa  362  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  36.36 
 
 		 718 aa  360  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  36.25 
 
 		 832 aa  356  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.66 
 
 		 758 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.8 
 
 		 737 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  35.23 
 
 		 735 aa  351  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.98 
 
 		 724 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  34.94 
 
 		 737 aa  346  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  37.09 
 
 		 724 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  35.78 
 
 		 726 aa  343  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  37.17 
 
 		 711 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.12 
 
 		 829 aa  338  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.12 
 
 		 829 aa  338  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  34.74 
 
 		 909 aa  335  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 		 793 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 779 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  35.7 
 
 		 734 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  35.15 
 
 		 917 aa  328  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.16 
 
 		 714 aa  327  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  34.4 
 
 		 920 aa  324  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  32.69 
 
 		 787 aa  323  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  34.97 
 
 		 732 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  32.1 
 
 		 758 aa  318  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.31 
 
 		 742 aa  316  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  36.87 
 
 		 781 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  32.27 
 
 		 760 aa  314  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  32.95 
 
 		 772 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  32.95 
 
 		 772 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  32.95 
 
 		 772 aa  313  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  29.81 
 
 		 704 aa  310  8e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.34 
 
 		 893 aa  309  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.66 
 
 		 746 aa  307  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  33.02 
 
 		 749 aa  303  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  35.92 
 
 		 1002 aa  300  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  34.06 
 
 		 787 aa  299  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  34.81 
 
 		 779 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.61 
 
 		 983 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.61 
 
 		 983 aa  297  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.34 
 
 		 979 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.96 
 
 		 740 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  37.41 
 
 		 968 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  33.83 
 
 		 734 aa  287  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  37.7 
 
 		 978 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.09 
 
 		 710 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  33.11 
 
 		 734 aa  280  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  33.2 
 
 		 807 aa  273  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.2 
 
 		 743 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  34.99 
 
 		 903 aa  272  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  30.44 
 
 		 741 aa  271  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  34.7 
 
 		 738 aa  270  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  36.43 
 
 		 854 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  37.91 
 
 		 784 aa  267  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  32.01 
 
 		 791 aa  267  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.24 
 
 		 1382 aa  266  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  36.28 
 
 		 966 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  32.18 
 
 		 729 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  34.2 
 
 		 843 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.65 
 
 		 737 aa  256  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  32.05 
 
 		 741 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  35.44 
 
 		 733 aa  253  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  35.46 
 
 		 840 aa  253  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  32.31 
 
 		 766 aa  249  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  33.47 
 
 		 726 aa  249  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.86 
 
 		 1308 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.42 
 
 		 846 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  33.29 
 
 		 745 aa  247  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.48 
 
 		 1095 aa  247  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  48.41 
 
 		 776 aa  245  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  32.68 
 
 		 732 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 736 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  30.57 
 
 		 718 aa  244  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  34.8 
 
 		 1092 aa  244  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  31.46 
 
 		 1058 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  29.72 
 
 		 1155 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  30.86 
 
 		 727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.91 
 
 		 738 aa  240  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0144  MMPL domain-containing protein  33.06 
 
 		 718 aa  239  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  33.08 
 
 		 751 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>