More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4242 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 842 aa  1642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  43.58 
 
 		 735 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  43.84 
 
 		 752 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  43.15 
 
 		 758 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  41.26 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  44.51 
 
 		 718 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  40.6 
 
 		 743 aa  475  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  43.24 
 
 		 731 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  41.18 
 
 		 737 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  41.77 
 
 		 732 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  43.12 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  40.93 
 
 		 728 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.02 
 
 		 796 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  41.39 
 
 		 832 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  41.9 
 
 		 723 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  41.31 
 
 		 737 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  39.67 
 
 		 734 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  39.16 
 
 		 760 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  41.35 
 
 		 723 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  40.66 
 
 		 876 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  41.43 
 
 		 755 aa  435  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  40.74 
 
 		 793 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  39.45 
 
 		 729 aa  432  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  40.88 
 
 		 734 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  39.43 
 
 		 781 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  44.99 
 
 		 724 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  37.52 
 
 		 920 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  39.16 
 
 		 735 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  32.29 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  32.29 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  38.73 
 
 		 735 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  41.35 
 
 		 724 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  38.66 
 
 		 732 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  37.48 
 
 		 742 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  38.04 
 
 		 909 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.74 
 
 		 735 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  40.82 
 
 		 751 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  38.7 
 
 		 740 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  38.15 
 
 		 787 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  32.83 
 
 		 893 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  40.25 
 
 		 761 aa  392  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  38.91 
 
 		 1002 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  38.13 
 
 		 917 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  41.06 
 
 		 715 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  39 
 
 		 750 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  36.09 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  36.09 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  36.09 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  40.3 
 
 		 743 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  33.85 
 
 		 779 aa  372  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  39.8 
 
 		 903 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.91 
 
 		 704 aa  366  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  39.38 
 
 		 714 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  37.38 
 
 		 711 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.66 
 
 		 749 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  33.68 
 
 		 779 aa  356  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  38.25 
 
 		 854 aa  354  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  37.78 
 
 		 958 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  38.88 
 
 		 903 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  36.86 
 
 		 784 aa  344  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  37.45 
 
 		 807 aa  343  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  36.33 
 
 		 734 aa  342  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  35.09 
 
 		 791 aa  340  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.87 
 
 		 979 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.87 
 
 		 983 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.87 
 
 		 983 aa  335  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.43 
 
 		 1382 aa  331  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.02 
 
 		 746 aa  330  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  37.6 
 
 		 1092 aa  330  8e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  34.51 
 
 		 787 aa  328  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  38.01 
 
 		 734 aa  326  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  38.69 
 
 		 843 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  36.72 
 
 		 732 aa  323  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  38.76 
 
 		 968 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  37.48 
 
 		 978 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  37.17 
 
 		 737 aa  319  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  35.99 
 
 		 1058 aa  318  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.52 
 
 		 966 aa  315  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  30.52 
 
 		 758 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  39.34 
 
 		 840 aa  309  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 846 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  34.58 
 
 		 729 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  37.74 
 
 		 738 aa  300  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  33.51 
 
 		 740 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.69 
 
 		 726 aa  294  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  33.78 
 
 		 743 aa  275  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  40.28 
 
 		 726 aa  273  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.94 
 
 		 1155 aa  269  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  35.24 
 
 		 737 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  32.02 
 
 		 796 aa  267  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  37.88 
 
 		 732 aa  267  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.72 
 
 		 741 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  34.89 
 
 		 717 aa  264  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.94 
 
 		 730 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.7 
 
 		 745 aa  263  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.85 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  46.09 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  32.24 
 
 		 744 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.24 
 
 		 730 aa  259  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.34 
 
 		 730 aa  259  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>